Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
PRDM2Q13029 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
PRDM2Q13029 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
PRDM2Q13029 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
PRDM2Q13029 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.71
PRDM2Q13029 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.71
PRDM2Q13029 MIR513B-201ENST00000385136 84 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.71
PRDM2Q13029 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.71
PRDM2Q13029 RNU2-66P-201ENST00000410650 161 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.71
PRDM2Q13029 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC-1.91□□□□□ -2.71
PRDM2Q13029 RNU7-125P-201ENST00000458760 62 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.71
PRDM2Q13029 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.71
PRDM2Q13029 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.71
PRDM2Q13029 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.71
PRDM2Q13029 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.71
PRDM2Q13029 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.71
PRDM2Q13029 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
PRDM2Q13029 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
PRDM2Q13029 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
PRDM2Q13029 AL009048.1-201ENST00000450437 298 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
PRDM2Q13029 VTRNA2-1-201ENST00000602301 127 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
PRDM2Q13029 Z69908.1-201ENST00000622603 247 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
PRDM2Q13029 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
PRDM2Q13029 MIRLET7B-201ENST00000385140 83 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
PRDM2Q13029 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
PRDM2Q13029 MTND3P12-201ENST00000559068 328 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
PRDM2Q13029 MIR3915-201ENST00000578518 97 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
PRDM2Q13029 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
PRDM2Q13029 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
PRDM2Q13029 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
PRDM2Q13029 RNA5SP405-201ENST00000363059 114 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
PRDM2Q13029 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
PRDM2Q13029 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC-1.93□□□□□ -2.72
PRDM2Q13029 AC060788.1-201ENST00000521318 469 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
PRDM2Q13029 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
PRDM2Q13029 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
PRDM2Q13029 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
PRDM2Q13029 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
PRDM2Q13029 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
PRDM2Q13029 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
PRDM2Q13029 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
PRDM2Q13029 MT-TH-201ENST00000387441 69 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
PRDM2Q13029 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
PRDM2Q13029 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
PRDM2Q13029 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
PRDM2Q13029 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
PRDM2Q13029 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
PRDM2Q13029 MIR122-201ENST00000385044 85 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
PRDM2Q13029 RNU6-337P-201ENST00000391243 106 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
PRDM2Q13029 RNU4-61P-201ENST00000411243 107 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
PRDM2Q13029 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
PRDM2Q13029 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
PRDM2Q13029 AL365203.2-201ENST00000423444 196 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
PRDM2Q13029 MRPS36P3-201ENST00000519284 130 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
PRDM2Q13029 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
PRDM2Q13029 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
PRDM2Q13029 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
PRDM2Q13029 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
PRDM2Q13029 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
PRDM2Q13029 MT-TM-201ENST00000387377 68 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
PRDM2Q13029 MIR548E-201ENST00000408287 88 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
PRDM2Q13029 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC-1.97□□□□□ -2.72
PRDM2Q13029 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
PRDM2Q13029 MIR6773-201ENST00000612812 74 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
PRDM2Q13029 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.73
PRDM2Q13029 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.73
PRDM2Q13029 RNU6-311P-201ENST00000516224 102 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.73
PRDM2Q13029 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.73
PRDM2Q13029 AC018767.1-201ENST00000566236 405 ntTSL 3 BASIC-1.97□□□□□ -2.73
PRDM2Q13029 MIR487B-201ENST00000385021 84 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
PRDM2Q13029 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
PRDM2Q13029 AC245505.1-201ENST00000556398 224 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
PRDM2Q13029 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
PRDM2Q13029 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
PRDM2Q13029 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
PRDM2Q13029 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
PRDM2Q13029 RNU6-194P-201ENST00000363862 105 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
PRDM2Q13029 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
PRDM2Q13029 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC-1.99□□□□□ -2.73
PRDM2Q13029 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
PRDM2Q13029 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
PRDM2Q13029 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
PRDM2Q13029 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
PRDM2Q13029 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
PRDM2Q13029 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
PRDM2Q13029 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
PRDM2Q13029 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
PRDM2Q13029 AC073641.1-201ENST00000425192 429 ntTSL 3 BASIC-2□□□□□ -2.73
PRDM2Q13029 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
PRDM2Q13029 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
PRDM2Q13029 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
PRDM2Q13029 SNORD115-23-201ENST00000364461 82 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
PRDM2Q13029 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
PRDM2Q13029 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
PRDM2Q13029 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
PRDM2Q13029 CR383656.11-201ENST00000552261 498 ntTSL 3 BASIC-2□□□□□ -2.73
PRDM2Q13029 LINC01984-201ENST00000583863 301 ntTSL 3 BASIC-2□□□□□ -2.73
PRDM2Q13029 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
PRDM2Q13029 MIR6874-201ENST00000635894 71 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
PRDM2Q13029 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
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