Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
LMAN2Q12907 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
LMAN2Q12907 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
LMAN2Q12907 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
LMAN2Q12907 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
LMAN2Q12907 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
LMAN2Q12907 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
LMAN2Q12907 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
LMAN2Q12907 RNU6-153P-201ENST00000364422 104 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
LMAN2Q12907 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
LMAN2Q12907 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
LMAN2Q12907 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
LMAN2Q12907 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
LMAN2Q12907 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
LMAN2Q12907 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
LMAN2Q12907 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
LMAN2Q12907 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
LMAN2Q12907 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
LMAN2Q12907 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
LMAN2Q12907 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
LMAN2Q12907 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
LMAN2Q12907 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
LMAN2Q12907 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
LMAN2Q12907 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
LMAN2Q12907 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
LMAN2Q12907 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
LMAN2Q12907 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
LMAN2Q12907 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
LMAN2Q12907 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
LMAN2Q12907 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
LMAN2Q12907 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
LMAN2Q12907 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
LMAN2Q12907 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
LMAN2Q12907 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
LMAN2Q12907 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
LMAN2Q12907 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
LMAN2Q12907 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
LMAN2Q12907 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
LMAN2Q12907 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
LMAN2Q12907 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
LMAN2Q12907 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
LMAN2Q12907 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
LMAN2Q12907 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
LMAN2Q12907 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
LMAN2Q12907 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
LMAN2Q12907 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
LMAN2Q12907 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
LMAN2Q12907 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
LMAN2Q12907 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
LMAN2Q12907 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
LMAN2Q12907 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
LMAN2Q12907 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
LMAN2Q12907 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
LMAN2Q12907 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
LMAN2Q12907 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
LMAN2Q12907 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
LMAN2Q12907 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
LMAN2Q12907 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
LMAN2Q12907 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
LMAN2Q12907 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
LMAN2Q12907 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
LMAN2Q12907 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
LMAN2Q12907 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
LMAN2Q12907 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
LMAN2Q12907 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
LMAN2Q12907 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
LMAN2Q12907 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
LMAN2Q12907 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
LMAN2Q12907 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC1.2□□□□□ -2.22
LMAN2Q12907 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
LMAN2Q12907 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
LMAN2Q12907 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
LMAN2Q12907 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
LMAN2Q12907 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
LMAN2Q12907 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
LMAN2Q12907 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
LMAN2Q12907 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
LMAN2Q12907 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
LMAN2Q12907 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.19□□□□□ -2.22
LMAN2Q12907 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
LMAN2Q12907 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
LMAN2Q12907 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
LMAN2Q12907 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
LMAN2Q12907 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
LMAN2Q12907 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
LMAN2Q12907 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
LMAN2Q12907 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
LMAN2Q12907 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC1.18□□□□□ -2.22
LMAN2Q12907 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
LMAN2Q12907 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
LMAN2Q12907 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
LMAN2Q12907 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
LMAN2Q12907 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
LMAN2Q12907 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
LMAN2Q12907 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
LMAN2Q12907 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
LMAN2Q12907 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
LMAN2Q12907 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
LMAN2Q12907 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
LMAN2Q12907 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
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