Protein–RNA interactions for Protein: P48230

TM4SF4, Transmembrane 4 L6 family member 4, humanhuman

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Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF4P48230 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
TM4SF4P48230 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
TM4SF4P48230 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
TM4SF4P48230 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
TM4SF4P48230 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.88□□□□□ -2.27
TM4SF4P48230 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TM4SF4P48230 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TM4SF4P48230 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TM4SF4P48230 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
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TM4SF4P48230 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TM4SF4P48230 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TM4SF4P48230 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
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TM4SF4P48230 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TM4SF4P48230 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
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TM4SF4P48230 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TM4SF4P48230 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TM4SF4P48230 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TM4SF4P48230 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TM4SF4P48230 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TM4SF4P48230 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TM4SF4P48230 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.85□□□□□ -2.27
TM4SF4P48230 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TM4SF4P48230 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TM4SF4P48230 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TM4SF4P48230 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TM4SF4P48230 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC0.85□□□□□ -2.27
TM4SF4P48230 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TM4SF4P48230 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TM4SF4P48230 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TM4SF4P48230 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TM4SF4P48230 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TM4SF4P48230 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TM4SF4P48230 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TM4SF4P48230 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TM4SF4P48230 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
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TM4SF4P48230 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC0.83□□□□□ -2.28
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TM4SF4P48230 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.77□□□□□ -2.29
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TM4SF4P48230 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
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TM4SF4P48230 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TM4SF4P48230 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
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