Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 MIR329-2-201ENST00000385029 84 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
HOXD10P28358 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
HOXD10P28358 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
HOXD10P28358 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
HOXD10P28358 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
HOXD10P28358 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
HOXD10P28358 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.33□□□□□ -2.36
HOXD10P28358 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
HOXD10P28358 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
HOXD10P28358 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
HOXD10P28358 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
HOXD10P28358 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
HOXD10P28358 RNU6-463P-201ENST00000384340 107 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
HOXD10P28358 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
HOXD10P28358 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
HOXD10P28358 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
HOXD10P28358 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
HOXD10P28358 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
HOXD10P28358 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
HOXD10P28358 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
HOXD10P28358 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
HOXD10P28358 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
HOXD10P28358 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
HOXD10P28358 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
HOXD10P28358 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
HOXD10P28358 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
HOXD10P28358 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
HOXD10P28358 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
HOXD10P28358 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC0.32□□□□□ -2.36
HOXD10P28358 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
HOXD10P28358 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
HOXD10P28358 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC0.31□□□□□ -2.36
HOXD10P28358 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
HOXD10P28358 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
HOXD10P28358 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
HOXD10P28358 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
HOXD10P28358 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
HOXD10P28358 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
HOXD10P28358 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
HOXD10P28358 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
HOXD10P28358 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
HOXD10P28358 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
HOXD10P28358 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
HOXD10P28358 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
HOXD10P28358 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
HOXD10P28358 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
HOXD10P28358 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
HOXD10P28358 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
HOXD10P28358 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
HOXD10P28358 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
HOXD10P28358 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
HOXD10P28358 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
HOXD10P28358 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
HOXD10P28358 HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 97 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
HOXD10P28358 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
HOXD10P28358 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
HOXD10P28358 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
HOXD10P28358 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
HOXD10P28358 AL078595.1-201ENST00000404458 226 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
HOXD10P28358 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
HOXD10P28358 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
HOXD10P28358 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
HOXD10P28358 MIR6718-201ENST00000616153 80 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
HOXD10P28358 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
HOXD10P28358 MIR6759-201ENST00000638110 65 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
HOXD10P28358 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
HOXD10P28358 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
HOXD10P28358 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
HOXD10P28358 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
HOXD10P28358 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
HOXD10P28358 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
HOXD10P28358 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
HOXD10P28358 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
HOXD10P28358 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
HOXD10P28358 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
HOXD10P28358 MIR4719-201ENST00000585233 84 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
HOXD10P28358 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
HOXD10P28358 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
HOXD10P28358 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
HOXD10P28358 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
HOXD10P28358 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
HOXD10P28358 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
HOXD10P28358 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
HOXD10P28358 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
HOXD10P28358 MIR5093-201ENST00000583199 100 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
HOXD10P28358 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC0.27□□□□□ -2.37
HOXD10P28358 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
HOXD10P28358 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
HOXD10P28358 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
HOXD10P28358 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
HOXD10P28358 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
HOXD10P28358 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
HOXD10P28358 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
HOXD10P28358 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
HOXD10P28358 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
HOXD10P28358 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
HOXD10P28358 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
HOXD10P28358 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
HOXD10P28358 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
HOXD10P28358 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
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