Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, human

Predictions only

Length 1,872 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene	UniProt Accession	Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TAF1	P21675	SNORD115-2-201	ENST00000362842	82 nt	BASIC	0.91	□□□□□ -2.26
TAF1	P21675	SNORD115-20-201	ENST00000365099	82 nt	BASIC	0.91	□□□□□ -2.26
TAF1	P21675	SNORA18-201	ENST00000384416	132 nt	BASIC	0.91	□□□□□ -2.26
TAF1	P21675	RNU6ATAC42P-201	ENST00000408637	95 nt	BASIC	0.91	□□□□□ -2.26
TAF1	P21675	RNU6-994P-201	ENST00000410507	111 nt	BASIC	0.91	□□□□□ -2.26
TAF1	P21675	Y_RNA.630-201	ENST00000411370	108 nt	BASIC	0.91	□□□□□ -2.26
TAF1	P21675	RPS26P5-201	ENST00000418544	335 nt	BASIC	0.91	□□□□□ -2.26
TAF1	P21675	CEP162-202	ENST00000403245	5156 nt	APPRIS P1 TSL 5 BASIC	0.9	□□□□□ -2.26
TAF1	P21675	RNA5SP327-201	ENST00000362494	101 nt	BASIC	0.9	□□□□□ -2.26
TAF1	P21675	RNY1P13-201	ENST00000365030	105 nt	BASIC	0.9	□□□□□ -2.26
TAF1	P21675	MIR520F-201	ENST00000384824	87 nt	BASIC	0.9	□□□□□ -2.26
TAF1	P21675	SNORD12-201	ENST00000391002	90 nt	BASIC	0.9	□□□□□ -2.26
TAF1	P21675	RNA5SP136-201	ENST00000410906	107 nt	BASIC	0.9	□□□□□ -2.26
TAF1	P21675	MTATP6P21-201	ENST00000440681	189 nt	BASIC	0.9	□□□□□ -2.26
TAF1	P21675	RNU6-448P-201	ENST00000517052	107 nt	BASIC	0.9	□□□□□ -2.26
TAF1	P21675	MTND5P34-201	ENST00000568888	325 nt	BASIC	0.9	□□□□□ -2.26
TAF1	P21675	AC023827.1-201	ENST00000569247	97 nt	BASIC	0.9	□□□□□ -2.26
TAF1	P21675	AC025627.3-201	ENST00000582078	182 nt	BASIC	0.9	□□□□□ -2.26
TAF1	P21675	RNU7-164P-201	ENST00000459221	62 nt	BASIC	0.9	□□□□□ -2.27
TAF1	P21675	MIR1270-201	ENST00000459320	83 nt	BASIC	0.9	□□□□□ -2.27
TAF1	P21675	RNU7-79P-201	ENST00000516082	62 nt	BASIC	0.9	□□□□□ -2.27
TAF1	P21675	RNU6-346P-201	ENST00000516288	111 nt	BASIC	0.9	□□□□□ -2.27
TAF1	P21675	AC133485.1-201	ENST00000567176	124 nt	BASIC	0.9	□□□□□ -2.27
TAF1	P21675	CALCRL-202	ENST00000409998	5223 nt	APPRIS P1 TSL 5 BASIC	0.89	□□□□□ -2.27
TAF1	P21675	SNORD114-10-201	ENST00000363409	72 nt	BASIC	0.89	□□□□□ -2.27
TAF1	P21675	Y_RNA.258-201	ENST00000364613	105 nt	BASIC	0.89	□□□□□ -2.27
TAF1	P21675	SNORD114-24-201	ENST00000365029	72 nt	BASIC	0.89	□□□□□ -2.27
TAF1	P21675	RNU6ATAC31P-201	ENST00000408513	126 nt	BASIC	0.89	□□□□□ -2.27
TAF1	P21675	RNU6-1190P-201	ENST00000410811	104 nt	BASIC	0.89	□□□□□ -2.27
TAF1	P21675	RNU6-1018P-201	ENST00000516577	106 nt	BASIC	0.89	□□□□□ -2.27
TAF1	P21675	MIR3910-1-201	ENST00000580936	111 nt	BASIC	0.89	□□□□□ -2.27
TAF1	P21675	uc_338.6-201	ENST00000613544	171 nt	BASIC	0.89	□□□□□ -2.27
TAF1	P21675	Y_RNA.528-201	ENST00000384575	108 nt	BASIC	0.88	□□□□□ -2.27
TAF1	P21675	Y_RNA.651-201	ENST00000459380	103 nt	BASIC	0.88	□□□□□ -2.27
TAF1	P21675	SNORD67.1-201	ENST00000516618	108 nt	BASIC	0.88	□□□□□ -2.27
TAF1	P21675	MIR3133-201	ENST00000583157	78 nt	BASIC	0.88	□□□□□ -2.27
TAF1	P21675	MIR924-201	ENST00000638017	53 nt	BASIC	0.88	□□□□□ -2.27
TAF1	P21675	Y_RNA.171-201	ENST00000363760	102 nt	BASIC	0.88	□□□□□ -2.27
TAF1	P21675	RNU6-22P-201	ENST00000384355	107 nt	BASIC	0.88	□□□□□ -2.27
TAF1	P21675	SNORD105-201	ENST00000386910	85 nt	BASIC	0.88	□□□□□ -2.27
TAF1	P21675	BX276092.1-201	ENST00000427368	251 nt	BASIC	0.88	□□□□□ -2.27
TAF1	P21675	RNU7-102P-201	ENST00000458948	62 nt	BASIC	0.88	□□□□□ -2.27
TAF1	P21675	RNU6-772P-201	ENST00000516042	105 nt	BASIC	0.88	□□□□□ -2.27
TAF1	P21675	AC023934.1-201	ENST00000574529	2389 nt	BASIC	0.87	□□□□□ -2.27
TAF1	P21675	RNU6-369P-201	ENST00000362515	102 nt	BASIC	0.87	□□□□□ -2.27
TAF1	P21675	RNU1-36P-201	ENST00000365130	165 nt	BASIC	0.87	□□□□□ -2.27
TAF1	P21675	Y_RNA.507-201	ENST00000384500	99 nt	BASIC	0.87	□□□□□ -2.27
TAF1	P21675	MIR206-201	ENST00000384872	86 nt	BASIC	0.87	□□□□□ -2.27
TAF1	P21675	MIR569-201	ENST00000385228	96 nt	BASIC	0.87	□□□□□ -2.27
TAF1	P21675	MT-TI-201	ENST00000387365	69 nt	BASIC	0.87	□□□□□ -2.27
TAF1	P21675	RNU6-1168P-201	ENST00000390831	104 nt	BASIC	0.87	□□□□□ -2.27
TAF1	P21675	SNORD93-201	ENST00000408813	74 nt	BASIC	0.87	□□□□□ -2.27
TAF1	P21675	RNU6-447P-201	ENST00000410293	104 nt	BASIC	0.87	□□□□□ -2.27
TAF1	P21675	RNA5SP193-201	ENST00000410353	107 nt	BASIC	0.87	□□□□□ -2.27
TAF1	P21675	RNU6-1118P-201	ENST00000410382	104 nt	BASIC	0.87	□□□□□ -2.27
TAF1	P21675	RNU6-1076P-201	ENST00000410397	104 nt	BASIC	0.87	□□□□□ -2.27
TAF1	P21675	RNU6-355P-201	ENST00000410427	104 nt	BASIC	0.87	□□□□□ -2.27
TAF1	P21675	RNU6-791P-201	ENST00000410467	104 nt	BASIC	0.87	□□□□□ -2.27
TAF1	P21675	RNU6-705P-201	ENST00000410601	104 nt	BASIC	0.87	□□□□□ -2.27
TAF1	P21675	RNU6-1100P-201	ENST00000410691	104 nt	BASIC	0.87	□□□□□ -2.27
TAF1	P21675	RNU6-860P-201	ENST00000410860	104 nt	BASIC	0.87	□□□□□ -2.27
TAF1	P21675	RNU6-1217P-201	ENST00000411276	104 nt	BASIC	0.87	□□□□□ -2.27
TAF1	P21675	RNU6-785P-201	ENST00000411324	104 nt	BASIC	0.87	□□□□□ -2.27
TAF1	P21675	RNU6-351P-201	ENST00000516097	100 nt	BASIC	0.87	□□□□□ -2.27
TAF1	P21675	AC138907.6-201	ENST00000568401	126 nt	BASIC	0.87	□□□□□ -2.27
TAF1	P21675	U6.90-201	ENST00000614007	104 nt	BASIC	0.87	□□□□□ -2.27
TAF1	P21675	U6.70-201	ENST00000620287	104 nt	BASIC	0.87	□□□□□ -2.27
TAF1	P21675	CCDC68-202	ENST00000432185	4014 nt	APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC	0.87	□□□□□ -2.27
TAF1	P21675	CCDC73-201	ENST00000335185	3849 nt	APPRIS P2 TSL 2 BASIC	0.87	□□□□□ -2.27
TAF1	P21675	C9orf84-205	ENST00000394779	5060 nt	APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC	0.86	□□□□□ -2.27
TAF1	P21675	MIR1-1-201	ENST00000362147	71 nt	BASIC	0.86	□□□□□ -2.27
TAF1	P21675	RNU4-58P-201	ENST00000363192	141 nt	BASIC	0.86	□□□□□ -2.27
TAF1	P21675	Y_RNA.115-201	ENST00000363272	98 nt	BASIC	0.86	□□□□□ -2.27
TAF1	P21675	SNORD115-35-201	ENST00000365122	82 nt	BASIC	0.86	□□□□□ -2.27
TAF1	P21675	Y_RNA.525-201	ENST00000384570	113 nt	BASIC	0.86	□□□□□ -2.27
TAF1	P21675	MIR520H-201	ENST00000385126	88 nt	BASIC	0.86	□□□□□ -2.27
TAF1	P21675	SNORD12C-201	ENST00000386307	89 nt	BASIC	0.86	□□□□□ -2.27
TAF1	P21675	MIR1197-201	ENST00000408818	88 nt	BASIC	0.86	□□□□□ -2.27
TAF1	P21675	RNU6-1165P-201	ENST00000410119	107 nt	BASIC	0.86	□□□□□ -2.27
TAF1	P21675	RNU6-229P-201	ENST00000516614	102 nt	BASIC	0.86	□□□□□ -2.27
TAF1	P21675	Y_RNA.114-201	ENST00000363265	113 nt	BASIC	0.86	□□□□□ -2.27
TAF1	P21675	RNA5SP62-201	ENST00000363457	110 nt	BASIC	0.86	□□□□□ -2.27
TAF1	P21675	Y_RNA.298-201	ENST00000364960	107 nt	BASIC	0.86	□□□□□ -2.27
TAF1	P21675	TRAJ1-201	ENST00000390536	62 nt	APPRIS P1 BASIC	0.86	□□□□□ -2.27
TAF1	P21675	RPL39P28-201	ENST00000465655	155 nt	BASIC	0.86	□□□□□ -2.27
TAF1	P21675	COX6CP6-201	ENST00000490840	228 nt	BASIC	0.86	□□□□□ -2.27
TAF1	P21675	RNU6-971P-201	ENST00000516920	106 nt	BASIC	0.86	□□□□□ -2.27
TAF1	P21675	MIR4771-2-201	ENST00000577758	74 nt	BASIC	0.86	□□□□□ -2.27
TAF1	P21675	MIR4711-201	ENST00000578274	70 nt	BASIC	0.86	□□□□□ -2.27
TAF1	P21675	MIR4771-1-201	ENST00000582617	74 nt	BASIC	0.86	□□□□□ -2.27
TAF1	P21675	ABCA5-201	ENST00000392676	8220 nt	APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC	0.85	□□□□□ -2.27
TAF1	P21675	RNU6-235P-201	ENST00000362644	107 nt	BASIC	0.85	□□□□□ -2.27
TAF1	P21675	SNORA22.1-201	ENST00000362701	134 nt	BASIC	0.85	□□□□□ -2.27
TAF1	P21675	Y_RNA.85-201	ENST00000363014	111 nt	BASIC	0.85	□□□□□ -2.27
TAF1	P21675	Y_RNA.178-201	ENST00000363832	102 nt	BASIC	0.85	□□□□□ -2.27
TAF1	P21675	SNORD124-201	ENST00000459577	104 nt	BASIC	0.85	□□□□□ -2.27
TAF1	P21675	RNU5E-3P-201	ENST00000515913	68 nt	BASIC	0.85	□□□□□ -2.27
TAF1	P21675	MIR4661-201	ENST00000582720	75 nt	BASIC	0.85	□□□□□ -2.27
TAF1	P21675	SNORD92-201	ENST00000585078	85 nt	BASIC	0.85	□□□□□ -2.27
TAF1	P21675	AC025166.1-201	ENST00000612411	163 nt	BASIC	0.85	□□□□□ -2.27

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