Protein–RNA interactions for Protein: P11473

VDR, Vitamin D3 receptor, humanhuman

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Length 427 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VDRP11473 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
VDRP11473 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
VDRP11473 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
VDRP11473 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
VDRP11473 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
VDRP11473 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
VDRP11473 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
VDRP11473 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
VDRP11473 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
VDRP11473 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
VDRP11473 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
VDRP11473 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
VDRP11473 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
VDRP11473 MIR1273G-201ENST00000577677 100 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
VDRP11473 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
VDRP11473 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
VDRP11473 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.54□□□□□ -2.32
VDRP11473 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
VDRP11473 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
VDRP11473 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
VDRP11473 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
VDRP11473 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
VDRP11473 MIR3668-201ENST00000582138 75 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
VDRP11473 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
VDRP11473 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
VDRP11473 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC0.54□□□□□ -2.32
VDRP11473 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
VDRP11473 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
VDRP11473 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
VDRP11473 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
VDRP11473 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
VDRP11473 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
VDRP11473 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
VDRP11473 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
VDRP11473 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
VDRP11473 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
VDRP11473 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
VDRP11473 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
VDRP11473 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
VDRP11473 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
VDRP11473 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
VDRP11473 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
VDRP11473 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
VDRP11473 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
VDRP11473 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
VDRP11473 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
VDRP11473 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
VDRP11473 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
VDRP11473 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
VDRP11473 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
VDRP11473 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
VDRP11473 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
VDRP11473 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
VDRP11473 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
VDRP11473 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
VDRP11473 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
VDRP11473 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
VDRP11473 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
VDRP11473 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
VDRP11473 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
VDRP11473 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC0.52□□□□□ -2.33
VDRP11473 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
VDRP11473 Y_RNA.115-201ENST00000363272 98 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
VDRP11473 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
VDRP11473 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
VDRP11473 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
VDRP11473 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
VDRP11473 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
VDRP11473 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
VDRP11473 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
VDRP11473 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
VDRP11473 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
VDRP11473 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
VDRP11473 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.5□□□□□ -2.33
VDRP11473 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
VDRP11473 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
VDRP11473 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
VDRP11473 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
VDRP11473 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
VDRP11473 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
VDRP11473 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
VDRP11473 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
VDRP11473 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
VDRP11473 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
VDRP11473 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
VDRP11473 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
VDRP11473 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
VDRP11473 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
VDRP11473 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
VDRP11473 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
VDRP11473 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
VDRP11473 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
VDRP11473 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
VDRP11473 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
VDRP11473 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
VDRP11473 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
VDRP11473 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
VDRP11473 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
VDRP11473 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
VDRP11473 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
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