Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.560-201ENST00000384689 102 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FGF7P6-202ENST00000451282 293 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-559P-201ENST00000516151 98 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR4509-3-201ENST00000578671 94 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR4509-2-201ENST00000583920 94 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR4509-1-201ENST00000618224 94 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC-2.1□□□□□ -2.75
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTND3P12-201ENST00000559068 328 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC090617.8-201ENST00000623339 167 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.223-201ENST00000364290 113 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR513B-201ENST00000385136 84 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.616-201ENST00000410835 95 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-720P-201ENST00000516363 108 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.678-201ENST00000516408 96 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC-2.11□□□□□ -2.75
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.250-201ENST00000364542 110 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
TRBV7-4A0A0J9YYF1 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-1233P-201ENST00000362922 102 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.543-201ENST00000384649 107 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTND1P34-201ENST00000438556 671 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL353691.2-201ENST00000443795 59 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.698-201ENST00000516798 118 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL021368.1-201ENST00000607490 540 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
TRBV7-4A0A0J9YYF1 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.655-201ENST00000515919 96 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.169-201ENST00000363745 96 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNY3P10-201ENST00000384764 102 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR487B-201ENST00000385021 84 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL009048.1-201ENST00000450437 298 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC060788.1-201ENST00000521318 469 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC-2.16□□□□□ -2.76
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC073114.1-201ENST00000612027 490 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
TRBV7-4A0A0J9YYF1 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR1468-201ENST00000410600 86 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC082651.2-201ENST00000496833 166 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 180 ms