Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SH3BP4Q9P0V3 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SH3BP4Q9P0V3 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SH3BP4Q9P0V3 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SH3BP4Q9P0V3 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.39□□□□□ -2.19
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SH3BP4Q9P0V3 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SH3BP4Q9P0V3 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SH3BP4Q9P0V3 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
SH3BP4Q9P0V3 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SH3BP4Q9P0V3 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
SH3BP4Q9P0V3 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
SH3BP4Q9P0V3 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SH3BP4Q9P0V3 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SH3BP4Q9P0V3 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SH3BP4Q9P0V3 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SH3BP4Q9P0V3 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SH3BP4Q9P0V3 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SH3BP4Q9P0V3 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SH3BP4Q9P0V3 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SH3BP4Q9P0V3 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC1.38□□□□□ -2.19
SH3BP4Q9P0V3 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SH3BP4Q9P0V3 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SH3BP4Q9P0V3 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SH3BP4Q9P0V3 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SH3BP4Q9P0V3 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SH3BP4Q9P0V3 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SH3BP4Q9P0V3 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SH3BP4Q9P0V3 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
SH3BP4Q9P0V3 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SH3BP4Q9P0V3 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SH3BP4Q9P0V3 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SH3BP4Q9P0V3 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-13P-201ENST00000384248 107 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
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SH3BP4Q9P0V3 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SH3BP4Q9P0V3 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SH3BP4Q9P0V3 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SH3BP4Q9P0V3 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SH3BP4Q9P0V3 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SH3BP4Q9P0V3 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
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SH3BP4Q9P0V3 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SH3BP4Q9P0V3 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SH3BP4Q9P0V3 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SH3BP4Q9P0V3 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SH3BP4Q9P0V3 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SH3BP4Q9P0V3 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SH3BP4Q9P0V3 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SH3BP4Q9P0V3 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SH3BP4Q9P0V3 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SH3BP4Q9P0V3 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SH3BP4Q9P0V3 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SH3BP4Q9P0V3 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-640P-201ENST00000363693 105 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SH3BP4Q9P0V3 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
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SH3BP4Q9P0V3 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SH3BP4Q9P0V3 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SH3BP4Q9P0V3 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SH3BP4Q9P0V3 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SH3BP4Q9P0V3 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SH3BP4Q9P0V3 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
SH3BP4Q9P0V3 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SH3BP4Q9P0V3 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SH3BP4Q9P0V3 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
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