Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYF3

FAM53C, Protein FAM53C, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53CQ9NYF3 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
FAM53CQ9NYF3 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
FAM53CQ9NYF3 RNU6-649P-201ENST00000384463 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
FAM53CQ9NYF3 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.18□□□□□ -2.06
FAM53CQ9NYF3 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
FAM53CQ9NYF3 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
FAM53CQ9NYF3 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
FAM53CQ9NYF3 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
FAM53CQ9NYF3 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
FAM53CQ9NYF3 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
FAM53CQ9NYF3 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
FAM53CQ9NYF3 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
FAM53CQ9NYF3 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
FAM53CQ9NYF3 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
FAM53CQ9NYF3 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
FAM53CQ9NYF3 MTND4LP19-201ENST00000403051 166 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
FAM53CQ9NYF3 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
FAM53CQ9NYF3 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
FAM53CQ9NYF3 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
FAM53CQ9NYF3 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
FAM53CQ9NYF3 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
FAM53CQ9NYF3 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
FAM53CQ9NYF3 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
FAM53CQ9NYF3 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
FAM53CQ9NYF3 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
FAM53CQ9NYF3 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
FAM53CQ9NYF3 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
FAM53CQ9NYF3 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
FAM53CQ9NYF3 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
FAM53CQ9NYF3 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
FAM53CQ9NYF3 RNU6-800P-201ENST00000384473 103 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
FAM53CQ9NYF3 RNU6-540P-201ENST00000384622 101 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
FAM53CQ9NYF3 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
FAM53CQ9NYF3 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
FAM53CQ9NYF3 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
FAM53CQ9NYF3 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
FAM53CQ9NYF3 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
FAM53CQ9NYF3 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
FAM53CQ9NYF3 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
FAM53CQ9NYF3 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
FAM53CQ9NYF3 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
FAM53CQ9NYF3 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
FAM53CQ9NYF3 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.14□□□□□ -2.07
FAM53CQ9NYF3 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
FAM53CQ9NYF3 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC2.14□□□□□ -2.07
FAM53CQ9NYF3 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
FAM53CQ9NYF3 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
FAM53CQ9NYF3 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
FAM53CQ9NYF3 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
FAM53CQ9NYF3 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
FAM53CQ9NYF3 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
FAM53CQ9NYF3 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
FAM53CQ9NYF3 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
FAM53CQ9NYF3 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
FAM53CQ9NYF3 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
FAM53CQ9NYF3 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
FAM53CQ9NYF3 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
FAM53CQ9NYF3 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
FAM53CQ9NYF3 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
FAM53CQ9NYF3 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
FAM53CQ9NYF3 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
FAM53CQ9NYF3 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
FAM53CQ9NYF3 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
FAM53CQ9NYF3 SNORD30.1-201ENST00000391309 70 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
FAM53CQ9NYF3 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
FAM53CQ9NYF3 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
FAM53CQ9NYF3 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
FAM53CQ9NYF3 U6.111-201ENST00000636093 83 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
FAM53CQ9NYF3 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
FAM53CQ9NYF3 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
FAM53CQ9NYF3 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
FAM53CQ9NYF3 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
FAM53CQ9NYF3 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
FAM53CQ9NYF3 RNU6-471P-201ENST00000383944 106 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
FAM53CQ9NYF3 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
FAM53CQ9NYF3 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
FAM53CQ9NYF3 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
FAM53CQ9NYF3 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
FAM53CQ9NYF3 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
FAM53CQ9NYF3 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
FAM53CQ9NYF3 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
FAM53CQ9NYF3 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
FAM53CQ9NYF3 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
FAM53CQ9NYF3 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
FAM53CQ9NYF3 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
FAM53CQ9NYF3 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
FAM53CQ9NYF3 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
FAM53CQ9NYF3 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
FAM53CQ9NYF3 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
FAM53CQ9NYF3 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
FAM53CQ9NYF3 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
FAM53CQ9NYF3 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
FAM53CQ9NYF3 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
FAM53CQ9NYF3 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
FAM53CQ9NYF3 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
FAM53CQ9NYF3 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
FAM53CQ9NYF3 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
FAM53CQ9NYF3 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
FAM53CQ9NYF3 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
FAM53CQ9NYF3 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 218.6 ms