Protein–RNA interactions for Protein: Q99959

PKP2, Plakophilin-2, humanhuman

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Length 881 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP2Q99959 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
PKP2Q99959 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PKP2Q99959 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PKP2Q99959 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PKP2Q99959 SNORD113-1-201ENST00000365321 69 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PKP2Q99959 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PKP2Q99959 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PKP2Q99959 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
PKP2Q99959 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PKP2Q99959 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PKP2Q99959 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PKP2Q99959 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
PKP2Q99959 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PKP2Q99959 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PKP2Q99959 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PKP2Q99959 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
PKP2Q99959 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PKP2Q99959 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PKP2Q99959 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PKP2Q99959 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PKP2Q99959 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PKP2Q99959 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
PKP2Q99959 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PKP2Q99959 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PKP2Q99959 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PKP2Q99959 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PKP2Q99959 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PKP2Q99959 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
PKP2Q99959 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PKP2Q99959 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PKP2Q99959 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PKP2Q99959 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PKP2Q99959 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PKP2Q99959 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PKP2Q99959 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
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PKP2Q99959 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PKP2Q99959 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PKP2Q99959 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PKP2Q99959 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PKP2Q99959 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
PKP2Q99959 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
PKP2Q99959 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PKP2Q99959 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
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PKP2Q99959 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
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PKP2Q99959 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
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PKP2Q99959 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.9□□□□□ -2.27
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PKP2Q99959 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
PKP2Q99959 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
PKP2Q99959 RNU6-22P-201ENST00000384355 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
PKP2Q99959 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
PKP2Q99959 MIR193B-201ENST00000384907 83 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
PKP2Q99959 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
PKP2Q99959 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
PKP2Q99959 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
PKP2Q99959 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
PKP2Q99959 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
PKP2Q99959 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
PKP2Q99959 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
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