Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 826 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HIF1AQ16665 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HIF1AQ16665 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HIF1AQ16665 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HIF1AQ16665 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC2.34□□□□□ -2.03
HIF1AQ16665 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HIF1AQ16665 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HIF1AQ16665 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HIF1AQ16665 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HIF1AQ16665 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HIF1AQ16665 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HIF1AQ16665 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
HIF1AQ16665 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HIF1AQ16665 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HIF1AQ16665 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
HIF1AQ16665 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HIF1AQ16665 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
HIF1AQ16665 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HIF1AQ16665 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HIF1AQ16665 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
HIF1AQ16665 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HIF1AQ16665 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HIF1AQ16665 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HIF1AQ16665 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HIF1AQ16665 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HIF1AQ16665 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HIF1AQ16665 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HIF1AQ16665 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
HIF1AQ16665 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HIF1AQ16665 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HIF1AQ16665 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HIF1AQ16665 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HIF1AQ16665 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HIF1AQ16665 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
HIF1AQ16665 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HIF1AQ16665 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HIF1AQ16665 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HIF1AQ16665 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HIF1AQ16665 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HIF1AQ16665 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HIF1AQ16665 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
HIF1AQ16665 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HIF1AQ16665 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HIF1AQ16665 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HIF1AQ16665 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HIF1AQ16665 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HIF1AQ16665 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HIF1AQ16665 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HIF1AQ16665 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HIF1AQ16665 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HIF1AQ16665 RNU6-857P-201ENST00000515893 110 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HIF1AQ16665 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
HIF1AQ16665 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HIF1AQ16665 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HIF1AQ16665 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HIF1AQ16665 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
HIF1AQ16665 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.3□□□□□ -2.04
HIF1AQ16665 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
HIF1AQ16665 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HIF1AQ16665 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HIF1AQ16665 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HIF1AQ16665 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HIF1AQ16665 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HIF1AQ16665 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HIF1AQ16665 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HIF1AQ16665 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HIF1AQ16665 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HIF1AQ16665 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HIF1AQ16665 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
HIF1AQ16665 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
HIF1AQ16665 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HIF1AQ16665 RNU6-279P-201ENST00000391297 101 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HIF1AQ16665 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
HIF1AQ16665 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HIF1AQ16665 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HIF1AQ16665 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HIF1AQ16665 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HIF1AQ16665 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
HIF1AQ16665 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
HIF1AQ16665 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HIF1AQ16665 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HIF1AQ16665 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HIF1AQ16665 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HIF1AQ16665 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HIF1AQ16665 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HIF1AQ16665 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
HIF1AQ16665 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
HIF1AQ16665 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
HIF1AQ16665 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HIF1AQ16665 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HIF1AQ16665 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HIF1AQ16665 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
HIF1AQ16665 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HIF1AQ16665 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HIF1AQ16665 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HIF1AQ16665 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HIF1AQ16665 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
HIF1AQ16665 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
HIF1AQ16665 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HIF1AQ16665 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 586.4 ms