Protein–RNA interactions for Protein: Q16650

TBR1, T-box brain protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 682 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBR1Q16650 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TBR1Q16650 MIR1302-4-201ENST00000408701 150 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TBR1Q16650 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TBR1Q16650 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TBR1Q16650 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TBR1Q16650 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TBR1Q16650 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TBR1Q16650 RNU6-294P-201ENST00000364999 102 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TBR1Q16650 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TBR1Q16650 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TBR1Q16650 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TBR1Q16650 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TBR1Q16650 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TBR1Q16650 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TBR1Q16650 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TBR1Q16650 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TBR1Q16650 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TBR1Q16650 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TBR1Q16650 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
TBR1Q16650 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TBR1Q16650 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
TBR1Q16650 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TBR1Q16650 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TBR1Q16650 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TBR1Q16650 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TBR1Q16650 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TBR1Q16650 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TBR1Q16650 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TBR1Q16650 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TBR1Q16650 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TBR1Q16650 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TBR1Q16650 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TBR1Q16650 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TBR1Q16650 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TBR1Q16650 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TBR1Q16650 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
TBR1Q16650 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TBR1Q16650 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TBR1Q16650 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
TBR1Q16650 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TBR1Q16650 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TBR1Q16650 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TBR1Q16650 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TBR1Q16650 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TBR1Q16650 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TBR1Q16650 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TBR1Q16650 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TBR1Q16650 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TBR1Q16650 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TBR1Q16650 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TBR1Q16650 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TBR1Q16650 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TBR1Q16650 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TBR1Q16650 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TBR1Q16650 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TBR1Q16650 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TBR1Q16650 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
TBR1Q16650 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TBR1Q16650 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TBR1Q16650 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TBR1Q16650 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TBR1Q16650 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TBR1Q16650 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TBR1Q16650 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TBR1Q16650 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TBR1Q16650 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
TBR1Q16650 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
TBR1Q16650 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TBR1Q16650 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TBR1Q16650 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TBR1Q16650 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TBR1Q16650 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TBR1Q16650 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TBR1Q16650 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TBR1Q16650 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TBR1Q16650 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TBR1Q16650 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TBR1Q16650 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TBR1Q16650 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
TBR1Q16650 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
TBR1Q16650 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TBR1Q16650 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TBR1Q16650 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC1.67□□□□□ -2.14
TBR1Q16650 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TBR1Q16650 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TBR1Q16650 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TBR1Q16650 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TBR1Q16650 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TBR1Q16650 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TBR1Q16650 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TBR1Q16650 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TBR1Q16650 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TBR1Q16650 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TBR1Q16650 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TBR1Q16650 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TBR1Q16650 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TBR1Q16650 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TBR1Q16650 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TBR1Q16650 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TBR1Q16650 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.66□□□□□ -2.14
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