Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 RBMX2P4-201ENST00000441256 376 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
SSX1Q16384 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
SSX1Q16384 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
SSX1Q16384 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
SSX1Q16384 SNORD114-28-201ENST00000363610 72 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
SSX1Q16384 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
SSX1Q16384 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
SSX1Q16384 SNORD49B-201ENST00000365172 72 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
SSX1Q16384 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
SSX1Q16384 MIR329-2-201ENST00000385029 84 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
SSX1Q16384 MIR876-201ENST00000401147 81 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
SSX1Q16384 Y_RNA.619-201ENST00000410951 90 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
SSX1Q16384 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
SSX1Q16384 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
SSX1Q16384 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
SSX1Q16384 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
SSX1Q16384 IGLVI-20-201ENST00000519296 130 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
SSX1Q16384 MIR4645-201ENST00000583158 77 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
SSX1Q16384 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
SSX1Q16384 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
SSX1Q16384 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SSX1Q16384 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SSX1Q16384 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SSX1Q16384 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SSX1Q16384 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SSX1Q16384 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SSX1Q16384 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SSX1Q16384 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SSX1Q16384 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SSX1Q16384 MIR8064-201ENST00000612863 90 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SSX1Q16384 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC-0.54□□□□□ -2.5
SSX1Q16384 AC084368.1-201ENST00000620935 65 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SSX1Q16384 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SSX1Q16384 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SSX1Q16384 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SSX1Q16384 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SSX1Q16384 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SSX1Q16384 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SSX1Q16384 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SSX1Q16384 AC082651.2-201ENST00000496833 166 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SSX1Q16384 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SSX1Q16384 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SSX1Q16384 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SSX1Q16384 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SSX1Q16384 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC-0.56□□□□□ -2.5
SSX1Q16384 Y_RNA.185-201ENST00000363894 100 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SSX1Q16384 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SSX1Q16384 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SSX1Q16384 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SSX1Q16384 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SSX1Q16384 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SSX1Q16384 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SSX1Q16384 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SSX1Q16384 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SSX1Q16384 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SSX1Q16384 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SSX1Q16384 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SSX1Q16384 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SSX1Q16384 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SSX1Q16384 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SSX1Q16384 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SSX1Q16384 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SSX1Q16384 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SSX1Q16384 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SSX1Q16384 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SSX1Q16384 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SSX1Q16384 AC139792.2-201ENST00000624218 587 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SSX1Q16384 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SSX1Q16384 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
SSX1Q16384 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
SSX1Q16384 SNORD14C-201ENST00000365382 88 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
SSX1Q16384 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
SSX1Q16384 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
SSX1Q16384 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
SSX1Q16384 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
SSX1Q16384 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC-0.58□□□□□ -2.5
SSX1Q16384 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
SSX1Q16384 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
SSX1Q16384 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
SSX1Q16384 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
SSX1Q16384 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
SSX1Q16384 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
SSX1Q16384 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
SSX1Q16384 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
SSX1Q16384 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
SSX1Q16384 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
SSX1Q16384 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SSX1Q16384 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SSX1Q16384 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SSX1Q16384 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SSX1Q16384 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SSX1Q16384 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SSX1Q16384 SNORA32.3-201ENST00000384772 121 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SSX1Q16384 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SSX1Q16384 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC-0.59□□□□□ -2.5
SSX1Q16384 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SSX1Q16384 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC-0.59□□□□□ -2.5
SSX1Q16384 MIR4788-201ENST00000639104 80 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SSX1Q16384 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SSX1Q16384 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 174.7 ms