Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SS18Q15532 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SS18Q15532 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SS18Q15532 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SS18Q15532 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SS18Q15532 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SS18Q15532 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SS18Q15532 MIR499B-201ENST00000636498 73 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SS18Q15532 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.01□□□□□ -2.41
SS18Q15532 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SS18Q15532 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SS18Q15532 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SS18Q15532 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SS18Q15532 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SS18Q15532 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SS18Q15532 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SS18Q15532 MIR643-201ENST00000385267 97 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SS18Q15532 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SS18Q15532 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SS18Q15532 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SS18Q15532 MIR4667-201ENST00000578933 66 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SS18Q15532 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SS18Q15532 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SS18Q15532 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SS18Q15532 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SS18Q15532 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SS18Q15532 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SS18Q15532 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SS18Q15532 RNU6-302P-201ENST00000365249 107 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SS18Q15532 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SS18Q15532 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SS18Q15532 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SS18Q15532 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SS18Q15532 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SS18Q15532 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SS18Q15532 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SS18Q15532 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SS18Q15532 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SS18Q15532 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SS18Q15532 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SS18Q15532 MIR4636-201ENST00000582271 80 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SS18Q15532 MIR4290-201ENST00000583807 95 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SS18Q15532 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SS18Q15532 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
SS18Q15532 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SS18Q15532 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SS18Q15532 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SS18Q15532 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SS18Q15532 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SS18Q15532 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SS18Q15532 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SS18Q15532 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SS18Q15532 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SS18Q15532 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SS18Q15532 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SS18Q15532 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SS18Q15532 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SS18Q15532 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SS18Q15532 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SS18Q15532 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SS18Q15532 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SS18Q15532 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SS18Q15532 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SS18Q15532 Y_RNA.185-201ENST00000363894 100 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SS18Q15532 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SS18Q15532 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SS18Q15532 RNU6-867P-201ENST00000364956 107 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SS18Q15532 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SS18Q15532 MIR593-201ENST00000384856 100 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SS18Q15532 MIR145-201ENST00000384967 88 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SS18Q15532 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SS18Q15532 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SS18Q15532 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SS18Q15532 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SS18Q15532 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SS18Q15532 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SS18Q15532 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SS18Q15532 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SS18Q15532 RNA5SP476-201ENST00000516613 103 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SS18Q15532 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SS18Q15532 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SS18Q15532 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SS18Q15532 MIR4802-201ENST00000581881 80 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SS18Q15532 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SS18Q15532 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SS18Q15532 MIR6086-201ENST00000638065 55 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SS18Q15532 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SS18Q15532 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SS18Q15532 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SS18Q15532 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SS18Q15532 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SS18Q15532 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SS18Q15532 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SS18Q15532 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SS18Q15532 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SS18Q15532 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
SS18Q15532 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SS18Q15532 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SS18Q15532 MTND4LP11-201ENST00000422184 280 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SS18Q15532 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.6 ms