Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 RNU7-188P-201ENST00000517063 64 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
SYCP1Q15431 AC024909.2-201ENST00000553035 286 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
SYCP1Q15431 WT1-AS_8.1-201ENST00000615200 275 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
SYCP1Q15431 NCRUPAR_2.1-201ENST00000616308 99 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
SYCP1Q15431 SNORD114-3-201ENST00000364969 75 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
SYCP1Q15431 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
SYCP1Q15431 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
SYCP1Q15431 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
SYCP1Q15431 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
SYCP1Q15431 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
SYCP1Q15431 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
SYCP1Q15431 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
SYCP1Q15431 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC-1.08□□□□□ -2.58
SYCP1Q15431 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
SYCP1Q15431 NDUFAF4P4-201ENST00000454883 502 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
SYCP1Q15431 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
SYCP1Q15431 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
SYCP1Q15431 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
SYCP1Q15431 RNU6-455P-201ENST00000384681 107 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
SYCP1Q15431 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
SYCP1Q15431 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
SYCP1Q15431 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
SYCP1Q15431 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
SYCP1Q15431 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
SYCP1Q15431 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
SYCP1Q15431 AC002553.4-201ENST00000616896 331 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
SYCP1Q15431 AC022079.1-201ENST00000621546 602 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
SYCP1Q15431 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
SYCP1Q15431 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
SYCP1Q15431 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
SYCP1Q15431 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
SYCP1Q15431 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
SYCP1Q15431 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
SYCP1Q15431 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
SYCP1Q15431 MIR4280-201ENST00000582178 76 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
SYCP1Q15431 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
SYCP1Q15431 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
SYCP1Q15431 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
SYCP1Q15431 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
SYCP1Q15431 MIR196A1-201ENST00000388006 70 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
SYCP1Q15431 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
SYCP1Q15431 SCARNA20.2-201ENST00000516052 116 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
SYCP1Q15431 RNA5SP461-201ENST00000516451 104 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
SYCP1Q15431 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
SYCP1Q15431 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
SYCP1Q15431 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
SYCP1Q15431 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
SYCP1Q15431 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
SYCP1Q15431 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
SYCP1Q15431 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
SYCP1Q15431 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
SYCP1Q15431 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
SYCP1Q15431 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
SYCP1Q15431 RNA5SP192-201ENST00000364404 120 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
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SYCP1Q15431 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
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SYCP1Q15431 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC-1.14□□□□□ -2.59
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SYCP1Q15431 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
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SYCP1Q15431 AL133368.2-201ENST00000556978 386 ntTSL 3 BASIC-1.15□□□□□ -2.59
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SYCP1Q15431 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
SYCP1Q15431 SNORD114-29-201ENST00000364819 70 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
SYCP1Q15431 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
SYCP1Q15431 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
SYCP1Q15431 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
SYCP1Q15431 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
SYCP1Q15431 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
SYCP1Q15431 SNORA13-201ENST00000458790 133 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
SYCP1Q15431 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
SYCP1Q15431 RNU6-559P-201ENST00000516151 98 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
SYCP1Q15431 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
SYCP1Q15431 MIR3115-201ENST00000577915 68 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
SYCP1Q15431 MIR6851-201ENST00000617060 67 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
SYCP1Q15431 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
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