Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PDCD1Q15116 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.42□□□□□ -2.18
PDCD1Q15116 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PDCD1Q15116 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PDCD1Q15116 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PDCD1Q15116 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PDCD1Q15116 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PDCD1Q15116 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
PDCD1Q15116 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
PDCD1Q15116 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PDCD1Q15116 Y_RNA.81-201ENST00000362997 102 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PDCD1Q15116 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PDCD1Q15116 RNU6-44P-201ENST00000384045 107 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PDCD1Q15116 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PDCD1Q15116 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PDCD1Q15116 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PDCD1Q15116 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PDCD1Q15116 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PDCD1Q15116 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PDCD1Q15116 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
PDCD1Q15116 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PDCD1Q15116 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PDCD1Q15116 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PDCD1Q15116 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PDCD1Q15116 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PDCD1Q15116 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PDCD1Q15116 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PDCD1Q15116 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PDCD1Q15116 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PDCD1Q15116 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PDCD1Q15116 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
PDCD1Q15116 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PDCD1Q15116 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PDCD1Q15116 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PDCD1Q15116 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PDCD1Q15116 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PDCD1Q15116 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.38□□□□□ -2.19
PDCD1Q15116 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PDCD1Q15116 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PDCD1Q15116 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PDCD1Q15116 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PDCD1Q15116 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PDCD1Q15116 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PDCD1Q15116 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PDCD1Q15116 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PDCD1Q15116 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC1.38□□□□□ -2.19
PDCD1Q15116 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PDCD1Q15116 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PDCD1Q15116 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PDCD1Q15116 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
PDCD1Q15116 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
PDCD1Q15116 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PDCD1Q15116 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PDCD1Q15116 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PDCD1Q15116 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PDCD1Q15116 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PDCD1Q15116 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PDCD1Q15116 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PDCD1Q15116 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PDCD1Q15116 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PDCD1Q15116 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PDCD1Q15116 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PDCD1Q15116 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PDCD1Q15116 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PDCD1Q15116 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PDCD1Q15116 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
PDCD1Q15116 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PDCD1Q15116 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PDCD1Q15116 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PDCD1Q15116 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PDCD1Q15116 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PDCD1Q15116 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PDCD1Q15116 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PDCD1Q15116 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PDCD1Q15116 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PDCD1Q15116 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PDCD1Q15116 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PDCD1Q15116 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PDCD1Q15116 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PDCD1Q15116 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PDCD1Q15116 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PDCD1Q15116 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PDCD1Q15116 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PDCD1Q15116 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PDCD1Q15116 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PDCD1Q15116 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PDCD1Q15116 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PDCD1Q15116 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PDCD1Q15116 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PDCD1Q15116 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PDCD1Q15116 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PDCD1Q15116 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PDCD1Q15116 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PDCD1Q15116 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC1.34□□□□□ -2.19
PDCD1Q15116 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PDCD1Q15116 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC1.34□□□□□ -2.19
PDCD1Q15116 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PDCD1Q15116 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PDCD1Q15116 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.34□□□□□ -2.2
PDCD1Q15116 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.2
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