Protein–RNA interactions for Protein: Q14406

CSHL1, Chorionic somatomammotropin hormone-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSHL1Q14406 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CSHL1Q14406 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CSHL1Q14406 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CSHL1Q14406 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CSHL1Q14406 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CSHL1Q14406 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CSHL1Q14406 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CSHL1Q14406 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CSHL1Q14406 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CSHL1Q14406 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CSHL1Q14406 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CSHL1Q14406 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CSHL1Q14406 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CSHL1Q14406 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CSHL1Q14406 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CSHL1Q14406 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
CSHL1Q14406 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CSHL1Q14406 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CSHL1Q14406 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CSHL1Q14406 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CSHL1Q14406 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CSHL1Q14406 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CSHL1Q14406 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CSHL1Q14406 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC1□□□□□ -2.25
CSHL1Q14406 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CSHL1Q14406 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CSHL1Q14406 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CSHL1Q14406 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CSHL1Q14406 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CSHL1Q14406 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CSHL1Q14406 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CSHL1Q14406 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CSHL1Q14406 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CSHL1Q14406 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CSHL1Q14406 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
CSHL1Q14406 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CSHL1Q14406 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CSHL1Q14406 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CSHL1Q14406 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CSHL1Q14406 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CSHL1Q14406 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CSHL1Q14406 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CSHL1Q14406 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CSHL1Q14406 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
CSHL1Q14406 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CSHL1Q14406 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CSHL1Q14406 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CSHL1Q14406 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC0.98□□□□□ -2.25
CSHL1Q14406 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CSHL1Q14406 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CSHL1Q14406 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CSHL1Q14406 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CSHL1Q14406 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CSHL1Q14406 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CSHL1Q14406 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CSHL1Q14406 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CSHL1Q14406 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CSHL1Q14406 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC0.97□□□□□ -2.25
CSHL1Q14406 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CSHL1Q14406 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
CSHL1Q14406 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CSHL1Q14406 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CSHL1Q14406 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.96□□□□□ -2.26
CSHL1Q14406 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CSHL1Q14406 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CSHL1Q14406 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CSHL1Q14406 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CSHL1Q14406 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CSHL1Q14406 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CSHL1Q14406 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CSHL1Q14406 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CSHL1Q14406 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CSHL1Q14406 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CSHL1Q14406 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CSHL1Q14406 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CSHL1Q14406 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CSHL1Q14406 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CSHL1Q14406 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CSHL1Q14406 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CSHL1Q14406 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CSHL1Q14406 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CSHL1Q14406 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CSHL1Q14406 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CSHL1Q14406 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CSHL1Q14406 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CSHL1Q14406 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CSHL1Q14406 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CSHL1Q14406 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CSHL1Q14406 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CSHL1Q14406 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CSHL1Q14406 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CSHL1Q14406 AL603908.1-201ENST00000406098 201 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CSHL1Q14406 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CSHL1Q14406 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CSHL1Q14406 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CSHL1Q14406 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CSHL1Q14406 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CSHL1Q14406 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CSHL1Q14406 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CSHL1Q14406 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
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