Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CNGB1Q14028 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CNGB1Q14028 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CNGB1Q14028 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CNGB1Q14028 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CNGB1Q14028 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CNGB1Q14028 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
CNGB1Q14028 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
CNGB1Q14028 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CNGB1Q14028 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CNGB1Q14028 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CNGB1Q14028 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CNGB1Q14028 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CNGB1Q14028 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CNGB1Q14028 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CNGB1Q14028 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CNGB1Q14028 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CNGB1Q14028 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CNGB1Q14028 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CNGB1Q14028 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CNGB1Q14028 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CNGB1Q14028 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CNGB1Q14028 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CNGB1Q14028 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CNGB1Q14028 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CNGB1Q14028 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CNGB1Q14028 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CNGB1Q14028 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CNGB1Q14028 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CNGB1Q14028 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CNGB1Q14028 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CNGB1Q14028 SNORD73B-201ENST00000364394 72 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CNGB1Q14028 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CNGB1Q14028 RNU6-294P-201ENST00000364999 102 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CNGB1Q14028 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CNGB1Q14028 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CNGB1Q14028 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CNGB1Q14028 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CNGB1Q14028 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CNGB1Q14028 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CNGB1Q14028 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
CNGB1Q14028 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CNGB1Q14028 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
CNGB1Q14028 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
CNGB1Q14028 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CNGB1Q14028 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CNGB1Q14028 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CNGB1Q14028 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CNGB1Q14028 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CNGB1Q14028 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CNGB1Q14028 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CNGB1Q14028 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CNGB1Q14028 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CNGB1Q14028 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CNGB1Q14028 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CNGB1Q14028 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CNGB1Q14028 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CNGB1Q14028 SNORA72.7-201ENST00000516349 94 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CNGB1Q14028 RNU6-762P-201ENST00000517107 102 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CNGB1Q14028 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CNGB1Q14028 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CNGB1Q14028 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CNGB1Q14028 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CNGB1Q14028 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CNGB1Q14028 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
CNGB1Q14028 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
CNGB1Q14028 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CNGB1Q14028 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CNGB1Q14028 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
CNGB1Q14028 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CNGB1Q14028 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CNGB1Q14028 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CNGB1Q14028 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CNGB1Q14028 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
CNGB1Q14028 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
CNGB1Q14028 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
CNGB1Q14028 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CNGB1Q14028 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CNGB1Q14028 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CNGB1Q14028 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CNGB1Q14028 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CNGB1Q14028 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CNGB1Q14028 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CNGB1Q14028 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CNGB1Q14028 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CNGB1Q14028 Y_RNA.388-201ENST00000383919 113 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CNGB1Q14028 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CNGB1Q14028 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CNGB1Q14028 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CNGB1Q14028 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CNGB1Q14028 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CNGB1Q14028 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CNGB1Q14028 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CNGB1Q14028 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CNGB1Q14028 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CNGB1Q14028 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CNGB1Q14028 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CNGB1Q14028 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CNGB1Q14028 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CNGB1Q14028 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
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