Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TOP3AQ13472 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TOP3AQ13472 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TOP3AQ13472 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TOP3AQ13472 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
TOP3AQ13472 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TOP3AQ13472 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TOP3AQ13472 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TOP3AQ13472 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TOP3AQ13472 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TOP3AQ13472 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TOP3AQ13472 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
TOP3AQ13472 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TOP3AQ13472 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TOP3AQ13472 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TOP3AQ13472 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TOP3AQ13472 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TOP3AQ13472 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TOP3AQ13472 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TOP3AQ13472 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TOP3AQ13472 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TOP3AQ13472 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TOP3AQ13472 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TOP3AQ13472 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TOP3AQ13472 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TOP3AQ13472 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TOP3AQ13472 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TOP3AQ13472 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TOP3AQ13472 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
TOP3AQ13472 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TOP3AQ13472 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TOP3AQ13472 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TOP3AQ13472 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TOP3AQ13472 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TOP3AQ13472 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TOP3AQ13472 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TOP3AQ13472 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TOP3AQ13472 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TOP3AQ13472 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
TOP3AQ13472 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
TOP3AQ13472 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
TOP3AQ13472 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
TOP3AQ13472 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
TOP3AQ13472 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
TOP3AQ13472 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
TOP3AQ13472 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
TOP3AQ13472 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
TOP3AQ13472 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
TOP3AQ13472 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
TOP3AQ13472 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
TOP3AQ13472 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
TOP3AQ13472 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
TOP3AQ13472 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
TOP3AQ13472 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
TOP3AQ13472 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
TOP3AQ13472 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
TOP3AQ13472 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
TOP3AQ13472 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
TOP3AQ13472 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
TOP3AQ13472 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
TOP3AQ13472 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
TOP3AQ13472 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
TOP3AQ13472 SNORD73B-201ENST00000364394 72 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
TOP3AQ13472 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
TOP3AQ13472 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
TOP3AQ13472 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
TOP3AQ13472 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
TOP3AQ13472 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
TOP3AQ13472 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
TOP3AQ13472 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
TOP3AQ13472 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
TOP3AQ13472 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
TOP3AQ13472 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
TOP3AQ13472 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
TOP3AQ13472 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
TOP3AQ13472 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
TOP3AQ13472 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
TOP3AQ13472 MIR1302-4-201ENST00000408701 150 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
TOP3AQ13472 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
TOP3AQ13472 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
TOP3AQ13472 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
TOP3AQ13472 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
TOP3AQ13472 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
TOP3AQ13472 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
TOP3AQ13472 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
TOP3AQ13472 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
TOP3AQ13472 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
TOP3AQ13472 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
TOP3AQ13472 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
TOP3AQ13472 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
TOP3AQ13472 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
TOP3AQ13472 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
TOP3AQ13472 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.61□□□□□ -2.15
TOP3AQ13472 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
TOP3AQ13472 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
TOP3AQ13472 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TOP3AQ13472 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TOP3AQ13472 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TOP3AQ13472 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TOP3AQ13472 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142.1 ms