Protein–RNA interactions for Protein: Q13405

MRPL49, 39S ribosomal protein L49, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL49Q13405 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
MRPL49Q13405 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
MRPL49Q13405 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
MRPL49Q13405 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
MRPL49Q13405 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
MRPL49Q13405 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
MRPL49Q13405 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
MRPL49Q13405 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
MRPL49Q13405 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
MRPL49Q13405 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.16
MRPL49Q13405 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
MRPL49Q13405 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
MRPL49Q13405 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
MRPL49Q13405 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
MRPL49Q13405 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
MRPL49Q13405 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
MRPL49Q13405 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
MRPL49Q13405 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
MRPL49Q13405 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
MRPL49Q13405 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
MRPL49Q13405 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
MRPL49Q13405 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
MRPL49Q13405 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
MRPL49Q13405 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
MRPL49Q13405 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
MRPL49Q13405 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
MRPL49Q13405 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
MRPL49Q13405 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
MRPL49Q13405 RNU6-13P-201ENST00000384248 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
MRPL49Q13405 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
MRPL49Q13405 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
MRPL49Q13405 RNU6-41P-201ENST00000384741 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
MRPL49Q13405 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
MRPL49Q13405 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
MRPL49Q13405 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
MRPL49Q13405 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
MRPL49Q13405 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
MRPL49Q13405 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
MRPL49Q13405 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
MRPL49Q13405 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
MRPL49Q13405 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
MRPL49Q13405 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
MRPL49Q13405 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.55□□□□□ -2.16
MRPL49Q13405 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
MRPL49Q13405 RNA5SP89-201ENST00000410300 108 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
MRPL49Q13405 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
MRPL49Q13405 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
MRPL49Q13405 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
MRPL49Q13405 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
MRPL49Q13405 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
MRPL49Q13405 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
MRPL49Q13405 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
MRPL49Q13405 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
MRPL49Q13405 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
MRPL49Q13405 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
MRPL49Q13405 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
MRPL49Q13405 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
MRPL49Q13405 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
MRPL49Q13405 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
MRPL49Q13405 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
MRPL49Q13405 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
MRPL49Q13405 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
MRPL49Q13405 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
MRPL49Q13405 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
MRPL49Q13405 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
MRPL49Q13405 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
MRPL49Q13405 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
MRPL49Q13405 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
MRPL49Q13405 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
MRPL49Q13405 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
MRPL49Q13405 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
MRPL49Q13405 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
MRPL49Q13405 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
MRPL49Q13405 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
MRPL49Q13405 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
MRPL49Q13405 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
MRPL49Q13405 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
MRPL49Q13405 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
MRPL49Q13405 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
MRPL49Q13405 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
MRPL49Q13405 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
MRPL49Q13405 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
MRPL49Q13405 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
MRPL49Q13405 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
MRPL49Q13405 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
MRPL49Q13405 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
MRPL49Q13405 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
MRPL49Q13405 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
MRPL49Q13405 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
MRPL49Q13405 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
MRPL49Q13405 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
MRPL49Q13405 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
MRPL49Q13405 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
MRPL49Q13405 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
MRPL49Q13405 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
MRPL49Q13405 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
MRPL49Q13405 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
MRPL49Q13405 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
MRPL49Q13405 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
MRPL49Q13405 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
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