Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

Predictions only

Length 3,056 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
ATMQ13315 AC133794.1-201ENST00000602731 914 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
ATMQ13315 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
ATMQ13315 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
ATMQ13315 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
ATMQ13315 RNU6-645P-201ENST00000364649 106 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
ATMQ13315 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
ATMQ13315 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
ATMQ13315 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
ATMQ13315 AL445264.1-201ENST00000621719 171 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
ATMQ13315 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
ATMQ13315 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
ATMQ13315 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
ATMQ13315 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
ATMQ13315 RNU6-995P-201ENST00000391244 107 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
ATMQ13315 MIR548AG1-201ENST00000579932 66 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
ATMQ13315 WT1-AS_8.1-201ENST00000615200 275 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
ATMQ13315 AL359920.1-201ENST00000618332 176 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
ATMQ13315 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
ATMQ13315 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
ATMQ13315 RNU6-1089P-201ENST00000516473 104 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
ATMQ13315 AP000720.1-201ENST00000625091 483 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
ATMQ13315 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
ATMQ13315 MIR217-201ENST00000384817 110 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
ATMQ13315 AL021921.1-201ENST00000442774 93 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
ATMQ13315 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
ATMQ13315 AC007494.3-201ENST00000624660 743 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
ATMQ13315 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
ATMQ13315 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC-2.33□□□□□ -2.78
ATMQ13315 MIR548AJ2-201ENST00000408539 92 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
ATMQ13315 AL121957.1-201ENST00000441532 338 ntTSL 2 BASIC-2.33□□□□□ -2.78
ATMQ13315 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
ATMQ13315 AC026741.1-201ENST00000605892 482 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
ATMQ13315 MTND2P31-201ENST00000512602 616 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
ATMQ13315 AL157955.1-201ENST00000554433 331 ntTSL 3 BASIC-2.33□□□□□ -2.78
ATMQ13315 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
ATMQ13315 AP002782.1-201ENST00000623107 614 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
ATMQ13315 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
ATMQ13315 MTND1P2-201ENST00000430604 821 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
ATMQ13315 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
ATMQ13315 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC-2.33□□□□□ -2.78
ATMQ13315 MIR6739-201ENST00000622461 75 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
ATMQ13315 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
ATMQ13315 Y_RNA.109-201ENST00000363215 102 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
ATMQ13315 RNU6-433P-201ENST00000363216 104 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
ATMQ13315 SNORD116-23-201ENST00000384645 92 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
ATMQ13315 RNU2-66P-201ENST00000410650 161 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
ATMQ13315 AC009961.2-201ENST00000435771 251 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
ATMQ13315 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
ATMQ13315 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
ATMQ13315 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
ATMQ13315 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
ATMQ13315 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
ATMQ13315 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
ATMQ13315 Y_RNA.63-201ENST00000362841 102 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
ATMQ13315 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
ATMQ13315 SNORD116-9-201ENST00000384000 95 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
ATMQ13315 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
ATMQ13315 SNORD116-3-201ENST00000384287 95 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
ATMQ13315 SNORD116-8-201ENST00000384365 95 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
ATMQ13315 SNORD116-7-201ENST00000384404 95 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
ATMQ13315 SNORD116-5-201ENST00000384462 95 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
ATMQ13315 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
ATMQ13315 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
ATMQ13315 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
ATMQ13315 RNU6-1161P-201ENST00000516176 102 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
ATMQ13315 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
ATMQ13315 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
ATMQ13315 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
ATMQ13315 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
ATMQ13315 U2.18-201ENST00000622185 84 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
ATMQ13315 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
ATMQ13315 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
ATMQ13315 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
ATMQ13315 Y_RNA.282-201ENST00000364793 102 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
ATMQ13315 RNU6-1316P-201ENST00000384242 108 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
ATMQ13315 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
ATMQ13315 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
ATMQ13315 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
ATMQ13315 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
ATMQ13315 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
ATMQ13315 MTATP6P15-201ENST00000527233 835 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
ATMQ13315 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
ATMQ13315 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
ATMQ13315 RNU6-150P-201ENST00000516237 95 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
ATMQ13315 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
ATMQ13315 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
ATMQ13315 MTND2P6-201ENST00000455337 1030 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
ATMQ13315 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
ATMQ13315 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
ATMQ13315 AC122108.2-201ENST00000611946 526 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
ATMQ13315 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
ATMQ13315 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
ATMQ13315 RNU5A-8P-201ENST00000364102 114 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
ATMQ13315 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
ATMQ13315 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
ATMQ13315 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC-2.38□□□□□ -2.79
ATMQ13315 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
ATMQ13315 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
ATMQ13315 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
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