Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CLN3Q13286 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CLN3Q13286 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CLN3Q13286 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
CLN3Q13286 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
CLN3Q13286 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CLN3Q13286 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CLN3Q13286 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CLN3Q13286 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CLN3Q13286 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CLN3Q13286 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CLN3Q13286 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
CLN3Q13286 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.48□□□□□ -2.01
CLN3Q13286 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CLN3Q13286 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CLN3Q13286 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CLN3Q13286 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CLN3Q13286 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CLN3Q13286 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CLN3Q13286 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CLN3Q13286 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CLN3Q13286 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CLN3Q13286 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CLN3Q13286 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CLN3Q13286 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CLN3Q13286 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CLN3Q13286 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CLN3Q13286 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CLN3Q13286 Y_RNA.545-201ENST00000384652 105 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CLN3Q13286 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CLN3Q13286 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CLN3Q13286 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CLN3Q13286 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CLN3Q13286 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CLN3Q13286 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
CLN3Q13286 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
CLN3Q13286 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CLN3Q13286 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CLN3Q13286 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CLN3Q13286 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CLN3Q13286 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CLN3Q13286 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CLN3Q13286 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CLN3Q13286 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CLN3Q13286 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CLN3Q13286 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CLN3Q13286 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CLN3Q13286 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
CLN3Q13286 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CLN3Q13286 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CLN3Q13286 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CLN3Q13286 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CLN3Q13286 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CLN3Q13286 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CLN3Q13286 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CLN3Q13286 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CLN3Q13286 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CLN3Q13286 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CLN3Q13286 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CLN3Q13286 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CLN3Q13286 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CLN3Q13286 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
CLN3Q13286 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
CLN3Q13286 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CLN3Q13286 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CLN3Q13286 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CLN3Q13286 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CLN3Q13286 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CLN3Q13286 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CLN3Q13286 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CLN3Q13286 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CLN3Q13286 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CLN3Q13286 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CLN3Q13286 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
CLN3Q13286 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CLN3Q13286 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CLN3Q13286 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CLN3Q13286 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CLN3Q13286 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CLN3Q13286 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CLN3Q13286 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CLN3Q13286 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CLN3Q13286 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CLN3Q13286 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CLN3Q13286 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
CLN3Q13286 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CLN3Q13286 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CLN3Q13286 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CLN3Q13286 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CLN3Q13286 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CLN3Q13286 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CLN3Q13286 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CLN3Q13286 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CLN3Q13286 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CLN3Q13286 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CLN3Q13286 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CLN3Q13286 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CLN3Q13286 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CLN3Q13286 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CLN3Q13286 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
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