Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
GPS1Q13098 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
GPS1Q13098 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
GPS1Q13098 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
GPS1Q13098 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
GPS1Q13098 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
GPS1Q13098 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
GPS1Q13098 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
GPS1Q13098 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
GPS1Q13098 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
GPS1Q13098 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
GPS1Q13098 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
GPS1Q13098 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
GPS1Q13098 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
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GPS1Q13098 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
GPS1Q13098 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
GPS1Q13098 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
GPS1Q13098 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
GPS1Q13098 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
GPS1Q13098 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
GPS1Q13098 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
GPS1Q13098 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
GPS1Q13098 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
GPS1Q13098 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
GPS1Q13098 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
GPS1Q13098 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
GPS1Q13098 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
GPS1Q13098 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
GPS1Q13098 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
GPS1Q13098 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
GPS1Q13098 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
GPS1Q13098 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
GPS1Q13098 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
GPS1Q13098 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
GPS1Q13098 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
GPS1Q13098 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
GPS1Q13098 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
GPS1Q13098 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
GPS1Q13098 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
GPS1Q13098 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
GPS1Q13098 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
GPS1Q13098 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
GPS1Q13098 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
GPS1Q13098 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
GPS1Q13098 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
GPS1Q13098 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
GPS1Q13098 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
GPS1Q13098 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
GPS1Q13098 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
GPS1Q13098 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
GPS1Q13098 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
GPS1Q13098 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
GPS1Q13098 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
GPS1Q13098 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
GPS1Q13098 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
GPS1Q13098 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
GPS1Q13098 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
GPS1Q13098 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
GPS1Q13098 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
GPS1Q13098 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
GPS1Q13098 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
GPS1Q13098 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
GPS1Q13098 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
GPS1Q13098 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
GPS1Q13098 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
GPS1Q13098 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
GPS1Q13098 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
GPS1Q13098 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
GPS1Q13098 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
GPS1Q13098 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
GPS1Q13098 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
GPS1Q13098 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC1□□□□□ -2.25
GPS1Q13098 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC1□□□□□ -2.25
GPS1Q13098 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC1□□□□□ -2.25
GPS1Q13098 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC1□□□□□ -2.25
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GPS1Q13098 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC1□□□□□ -2.25
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GPS1Q13098 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
GPS1Q13098 MIR3910-1-201ENST00000580936 111 ntBASIC1□□□□□ -2.25
GPS1Q13098 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC1□□□□□ -2.25
GPS1Q13098 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC1□□□□□ -2.25
GPS1Q13098 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC1□□□□□ -2.25
GPS1Q13098 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
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GPS1Q13098 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
GPS1Q13098 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
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GPS1Q13098 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
GPS1Q13098 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
GPS1Q13098 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
GPS1Q13098 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
GPS1Q13098 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
GPS1Q13098 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
GPS1Q13098 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
GPS1Q13098 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
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GPS1Q13098 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
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