Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 MIR633-201ENST00000384821 98 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
MKRN3Q13064 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
MKRN3Q13064 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
MKRN3Q13064 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
MKRN3Q13064 MIR4511-201ENST00000582784 87 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
MKRN3Q13064 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
MKRN3Q13064 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
MKRN3Q13064 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
MKRN3Q13064 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
MKRN3Q13064 AC103706.3-201ENST00000636297 85 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
MKRN3Q13064 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
MKRN3Q13064 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
MKRN3Q13064 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
MKRN3Q13064 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
MKRN3Q13064 AC079150.2-201ENST00000443733 78 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
MKRN3Q13064 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
MKRN3Q13064 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
MKRN3Q13064 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
MKRN3Q13064 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
MKRN3Q13064 SNORD115-22-201ENST00000364456 82 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
MKRN3Q13064 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
MKRN3Q13064 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
MKRN3Q13064 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
MKRN3Q13064 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
MKRN3Q13064 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
MKRN3Q13064 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
MKRN3Q13064 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
MKRN3Q13064 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
MKRN3Q13064 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
MKRN3Q13064 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
MKRN3Q13064 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
MKRN3Q13064 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
MKRN3Q13064 AC110620.1-201ENST00000416042 228 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
MKRN3Q13064 RNU1-143P-201ENST00000516296 146 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
MKRN3Q13064 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
MKRN3Q13064 U1.23-201ENST00000610293 146 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
MKRN3Q13064 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
MKRN3Q13064 RNU1-68P-201ENST00000615382 146 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
MKRN3Q13064 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
MKRN3Q13064 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
MKRN3Q13064 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
MKRN3Q13064 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
MKRN3Q13064 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
MKRN3Q13064 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
MKRN3Q13064 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
MKRN3Q13064 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
MKRN3Q13064 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
MKRN3Q13064 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.86
MKRN3Q13064 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.86
MKRN3Q13064 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
MKRN3Q13064 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
MKRN3Q13064 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
MKRN3Q13064 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
MKRN3Q13064 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
MKRN3Q13064 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
MKRN3Q13064 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
MKRN3Q13064 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
MKRN3Q13064 SCARNA20.6-201ENST00000517251 106 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
MKRN3Q13064 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
MKRN3Q13064 RNU6-1216P-201ENST00000362590 107 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
MKRN3Q13064 RNU6-669P-201ENST00000365575 107 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
MKRN3Q13064 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
MKRN3Q13064 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
MKRN3Q13064 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
MKRN3Q13064 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
MKRN3Q13064 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
MKRN3Q13064 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
MKRN3Q13064 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
MKRN3Q13064 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
MKRN3Q13064 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
MKRN3Q13064 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
MKRN3Q13064 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
MKRN3Q13064 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC3.38□□□□□ -1.87
MKRN3Q13064 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
MKRN3Q13064 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
MKRN3Q13064 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
MKRN3Q13064 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
MKRN3Q13064 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
MKRN3Q13064 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
MKRN3Q13064 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
MKRN3Q13064 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
MKRN3Q13064 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC3.37□□□□□ -1.87
MKRN3Q13064 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
MKRN3Q13064 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
MKRN3Q13064 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
MKRN3Q13064 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
MKRN3Q13064 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
MKRN3Q13064 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
MKRN3Q13064 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
MKRN3Q13064 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
MKRN3Q13064 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
MKRN3Q13064 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
MKRN3Q13064 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC3.37□□□□□ -1.87
MKRN3Q13064 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
MKRN3Q13064 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
MKRN3Q13064 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
MKRN3Q13064 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
MKRN3Q13064 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
MKRN3Q13064 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
MKRN3Q13064 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
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