Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
TRDNQ13061 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
TRDNQ13061 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC-0.39□□□□□ -2.47
TRDNQ13061 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
TRDNQ13061 MIR4677-201ENST00000584153 80 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
TRDNQ13061 MIR548AD-201ENST00000584780 82 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
TRDNQ13061 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
TRDNQ13061 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
TRDNQ13061 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC-0.39□□□□□ -2.47
TRDNQ13061 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
TRDNQ13061 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
TRDNQ13061 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
TRDNQ13061 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
TRDNQ13061 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
TRDNQ13061 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
TRDNQ13061 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
TRDNQ13061 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
TRDNQ13061 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
TRDNQ13061 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
TRDNQ13061 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
TRDNQ13061 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
TRDNQ13061 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
TRDNQ13061 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
TRDNQ13061 SNORD114-31-201ENST00000363219 75 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
TRDNQ13061 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
TRDNQ13061 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
TRDNQ13061 Y_RNA.505-201ENST00000384489 102 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
TRDNQ13061 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
TRDNQ13061 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
TRDNQ13061 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
TRDNQ13061 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
TRDNQ13061 RNU6-320P-201ENST00000516511 106 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
TRDNQ13061 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
TRDNQ13061 RNA5SP285-201ENST00000516619 119 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
TRDNQ13061 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
TRDNQ13061 MIR5706-201ENST00000579841 80 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
TRDNQ13061 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
TRDNQ13061 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
TRDNQ13061 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC-0.41□□□□□ -2.48
TRDNQ13061 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
TRDNQ13061 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
TRDNQ13061 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
TRDNQ13061 SNORD4A-201ENST00000459174 72 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
TRDNQ13061 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
TRDNQ13061 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
TRDNQ13061 Y_RNA.30-201ENST00000362572 97 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
TRDNQ13061 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
TRDNQ13061 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
TRDNQ13061 AC104692.1-201ENST00000472406 90 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
TRDNQ13061 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
TRDNQ13061 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
TRDNQ13061 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
TRDNQ13061 IGLVI-20-201ENST00000519296 130 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
TRDNQ13061 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
TRDNQ13061 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
TRDNQ13061 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
TRDNQ13061 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
TRDNQ13061 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
TRDNQ13061 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
TRDNQ13061 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
TRDNQ13061 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
TRDNQ13061 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
TRDNQ13061 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
TRDNQ13061 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
TRDNQ13061 RNU6-180P-201ENST00000516697 61 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
TRDNQ13061 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
TRDNQ13061 Y_RNA.185-201ENST00000363894 100 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
TRDNQ13061 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
TRDNQ13061 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
TRDNQ13061 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
TRDNQ13061 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
TRDNQ13061 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
TRDNQ13061 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
TRDNQ13061 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
TRDNQ13061 MIR6759-201ENST00000638110 65 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
TRDNQ13061 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
TRDNQ13061 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
TRDNQ13061 RNA5SP275-201ENST00000363936 118 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
TRDNQ13061 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
TRDNQ13061 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
TRDNQ13061 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
TRDNQ13061 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
TRDNQ13061 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
TRDNQ13061 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
TRDNQ13061 hsa-mir-3130-1.1-201ENST00000579223 75 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
TRDNQ13061 AC084368.1-201ENST00000620935 65 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
TRDNQ13061 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC-0.46□□□□□ -2.48
TRDNQ13061 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
TRDNQ13061 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
TRDNQ13061 AC096531.1-201ENST00000419107 107 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
TRDNQ13061 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
TRDNQ13061 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
TRDNQ13061 MIR4802-201ENST00000581881 80 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
TRDNQ13061 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
TRDNQ13061 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
TRDNQ13061 SNORA18.1-201ENST00000363418 128 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
TRDNQ13061 MIR516B1-201ENST00000385211 90 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
TRDNQ13061 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
TRDNQ13061 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
TRDNQ13061 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 185.8 ms