Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
PTP4A2Q12974 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
PTP4A2Q12974 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
PTP4A2Q12974 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
PTP4A2Q12974 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
PTP4A2Q12974 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
PTP4A2Q12974 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
PTP4A2Q12974 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
PTP4A2Q12974 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
PTP4A2Q12974 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC0.73□□□□□ -2.29
PTP4A2Q12974 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.72□□□□□ -2.29
PTP4A2Q12974 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PTP4A2Q12974 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PTP4A2Q12974 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.72□□□□□ -2.29
PTP4A2Q12974 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PTP4A2Q12974 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PTP4A2Q12974 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PTP4A2Q12974 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PTP4A2Q12974 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PTP4A2Q12974 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PTP4A2Q12974 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PTP4A2Q12974 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.72□□□□□ -2.29
PTP4A2Q12974 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.71□□□□□ -2.3
PTP4A2Q12974 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PTP4A2Q12974 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PTP4A2Q12974 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PTP4A2Q12974 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC0.71□□□□□ -2.3
PTP4A2Q12974 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PTP4A2Q12974 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PTP4A2Q12974 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PTP4A2Q12974 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PTP4A2Q12974 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PTP4A2Q12974 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PTP4A2Q12974 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PTP4A2Q12974 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PTP4A2Q12974 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC0.7□□□□□ -2.3
PTP4A2Q12974 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PTP4A2Q12974 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PTP4A2Q12974 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PTP4A2Q12974 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PTP4A2Q12974 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PTP4A2Q12974 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PTP4A2Q12974 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PTP4A2Q12974 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PTP4A2Q12974 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PTP4A2Q12974 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PTP4A2Q12974 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PTP4A2Q12974 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PTP4A2Q12974 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PTP4A2Q12974 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PTP4A2Q12974 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PTP4A2Q12974 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PTP4A2Q12974 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PTP4A2Q12974 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PTP4A2Q12974 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PTP4A2Q12974 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PTP4A2Q12974 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PTP4A2Q12974 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PTP4A2Q12974 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PTP4A2Q12974 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PTP4A2Q12974 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PTP4A2Q12974 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PTP4A2Q12974 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PTP4A2Q12974 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PTP4A2Q12974 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PTP4A2Q12974 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PTP4A2Q12974 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PTP4A2Q12974 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PTP4A2Q12974 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PTP4A2Q12974 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PTP4A2Q12974 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PTP4A2Q12974 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PTP4A2Q12974 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.64□□□□□ -2.31
PTP4A2Q12974 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PTP4A2Q12974 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PTP4A2Q12974 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PTP4A2Q12974 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PTP4A2Q12974 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PTP4A2Q12974 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PTP4A2Q12974 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PTP4A2Q12974 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PTP4A2Q12974 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.64□□□□□ -2.31
PTP4A2Q12974 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PTP4A2Q12974 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PTP4A2Q12974 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PTP4A2Q12974 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PTP4A2Q12974 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.63□□□□□ -2.31
PTP4A2Q12974 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PTP4A2Q12974 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PTP4A2Q12974 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PTP4A2Q12974 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.62□□□□□ -2.31
PTP4A2Q12974 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PTP4A2Q12974 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PTP4A2Q12974 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PTP4A2Q12974 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PTP4A2Q12974 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PTP4A2Q12974 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PTP4A2Q12974 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PTP4A2Q12974 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PTP4A2Q12974 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
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