Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
STX4Q12846 Y_RNA.696-201ENST00000516725 107 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
STX4Q12846 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
STX4Q12846 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
STX4Q12846 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC-0.78□□□□□ -2.53
STX4Q12846 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
STX4Q12846 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
STX4Q12846 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
STX4Q12846 MIR6507-201ENST00000613630 70 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
STX4Q12846 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
STX4Q12846 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC-0.78□□□□□ -2.53
STX4Q12846 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
STX4Q12846 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
STX4Q12846 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
STX4Q12846 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
STX4Q12846 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
STX4Q12846 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
STX4Q12846 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
STX4Q12846 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
STX4Q12846 Y_RNA.318-201ENST00000365131 97 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
STX4Q12846 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
STX4Q12846 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
STX4Q12846 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
STX4Q12846 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
STX4Q12846 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
STX4Q12846 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC-0.8□□□□□ -2.54
STX4Q12846 AL590491.3-201ENST00000610731 82 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
STX4Q12846 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC-0.81□□□□□ -2.54
STX4Q12846 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
STX4Q12846 SNORD95.1-201ENST00000364099 68 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
STX4Q12846 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
STX4Q12846 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
STX4Q12846 MIR516B1-201ENST00000385211 90 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
STX4Q12846 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
STX4Q12846 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC-0.81□□□□□ -2.54
STX4Q12846 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
STX4Q12846 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
STX4Q12846 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
STX4Q12846 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
STX4Q12846 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
STX4Q12846 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
STX4Q12846 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
STX4Q12846 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.82□□□□□ -2.54
STX4Q12846 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
STX4Q12846 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
STX4Q12846 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
STX4Q12846 RNU6-284P-201ENST00000411105 106 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
STX4Q12846 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
STX4Q12846 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
STX4Q12846 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
STX4Q12846 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
STX4Q12846 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
STX4Q12846 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
STX4Q12846 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
STX4Q12846 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
STX4Q12846 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
STX4Q12846 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
STX4Q12846 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
STX4Q12846 RNU4-63P-201ENST00000411313 118 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
STX4Q12846 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
STX4Q12846 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
STX4Q12846 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
STX4Q12846 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
STX4Q12846 SNORD114-11-201ENST00000363738 75 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
STX4Q12846 SNORD114-15-201ENST00000364687 72 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
STX4Q12846 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
STX4Q12846 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
STX4Q12846 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
STX4Q12846 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
STX4Q12846 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
STX4Q12846 AP005120.1-201ENST00000579321 352 ntTSL 3 BASIC-0.84□□□□□ -2.54
STX4Q12846 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
STX4Q12846 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
STX4Q12846 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
STX4Q12846 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
STX4Q12846 RNU6-30P-201ENST00000384561 107 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
STX4Q12846 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
STX4Q12846 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
STX4Q12846 Y_RNA.610-201ENST00000410681 103 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
STX4Q12846 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
STX4Q12846 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
STX4Q12846 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
STX4Q12846 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
STX4Q12846 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
STX4Q12846 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
STX4Q12846 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
STX4Q12846 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
STX4Q12846 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
STX4Q12846 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC-0.86□□□□□ -2.55
STX4Q12846 snoU13.19-201ENST00000459148 104 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
STX4Q12846 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC-0.86□□□□□ -2.55
STX4Q12846 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
STX4Q12846 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
STX4Q12846 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC-0.86□□□□□ -2.55
STX4Q12846 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
STX4Q12846 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
STX4Q12846 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
STX4Q12846 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
STX4Q12846 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
STX4Q12846 AC114755.3-201ENST00000481111 251 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
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