Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SFTPDP35247 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SFTPDP35247 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SFTPDP35247 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SFTPDP35247 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SFTPDP35247 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SFTPDP35247 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SFTPDP35247 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SFTPDP35247 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SFTPDP35247 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SFTPDP35247 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SFTPDP35247 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SFTPDP35247 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SFTPDP35247 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SFTPDP35247 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.5□□□□□ -2.33
SFTPDP35247 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SFTPDP35247 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SFTPDP35247 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SFTPDP35247 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SFTPDP35247 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SFTPDP35247 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SFTPDP35247 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SFTPDP35247 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SFTPDP35247 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC0.5□□□□□ -2.33
SFTPDP35247 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SFTPDP35247 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SFTPDP35247 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SFTPDP35247 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SFTPDP35247 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SFTPDP35247 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SFTPDP35247 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SFTPDP35247 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SFTPDP35247 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SFTPDP35247 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC0.49□□□□□ -2.33
SFTPDP35247 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC0.49□□□□□ -2.33
SFTPDP35247 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
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SFTPDP35247 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SFTPDP35247 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SFTPDP35247 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SFTPDP35247 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SFTPDP35247 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SFTPDP35247 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SFTPDP35247 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SFTPDP35247 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SFTPDP35247 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
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SFTPDP35247 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SFTPDP35247 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SFTPDP35247 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SFTPDP35247 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SFTPDP35247 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SFTPDP35247 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SFTPDP35247 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.44□□□□□ -2.34
SFTPDP35247 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SFTPDP35247 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SFTPDP35247 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
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