Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 RNU7-134P-201ENST00000458997 64 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
PTPRMP28827 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
PTPRMP28827 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
PTPRMP28827 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
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PTPRMP28827 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
PTPRMP28827 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
PTPRMP28827 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
PTPRMP28827 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
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PTPRMP28827 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
PTPRMP28827 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
PTPRMP28827 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
PTPRMP28827 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
PTPRMP28827 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC-1.67□□□□□ -2.68
PTPRMP28827 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
PTPRMP28827 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
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PTPRMP28827 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
PTPRMP28827 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
PTPRMP28827 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
PTPRMP28827 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
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PTPRMP28827 AL365203.2-201ENST00000423444 196 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
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PTPRMP28827 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
PTPRMP28827 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC-1.69□□□□□ -2.68
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PTPRMP28827 AL390783.1-203ENST00000457058 248 ntTSL 3 BASIC-1.69□□□□□ -2.68
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PTPRMP28827 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC-1.71□□□□□ -2.68
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PTPRMP28827 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
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PTPRMP28827 ULK3-223ENST00000631115 126 ntTSL 5 BASIC-1.73□□□□□ -2.69
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PTPRMP28827 SNORD114-17-201ENST00000364699 75 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
PTPRMP28827 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
PTPRMP28827 RNA5SP86-201ENST00000390869 98 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
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PTPRMP28827 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
PTPRMP28827 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
PTPRMP28827 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
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PTPRMP28827 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
PTPRMP28827 AC107308.1-201ENST00000615897 301 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
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