Protein–RNA interactions for Protein: O14717

TRDMT1, tRNA (cytosine(38)-C(5))-methyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDMT1O14717 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
TRDMT1O14717 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
TRDMT1O14717 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC-0.57□□□□□ -2.5
TRDMT1O14717 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
TRDMT1O14717 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
TRDMT1O14717 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
TRDMT1O14717 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
TRDMT1O14717 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
TRDMT1O14717 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC-0.57□□□□□ -2.5
TRDMT1O14717 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC-0.57□□□□□ -2.5
TRDMT1O14717 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
TRDMT1O14717 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
TRDMT1O14717 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
TRDMT1O14717 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
TRDMT1O14717 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
TRDMT1O14717 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
TRDMT1O14717 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
TRDMT1O14717 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
TRDMT1O14717 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
TRDMT1O14717 RNU6-284P-201ENST00000411105 106 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
TRDMT1O14717 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
TRDMT1O14717 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
TRDMT1O14717 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
TRDMT1O14717 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
TRDMT1O14717 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
TRDMT1O14717 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
TRDMT1O14717 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
TRDMT1O14717 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
TRDMT1O14717 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
TRDMT1O14717 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
TRDMT1O14717 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC-0.59□□□□□ -2.5
TRDMT1O14717 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
TRDMT1O14717 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
TRDMT1O14717 AC114755.3-201ENST00000481111 251 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
TRDMT1O14717 AC093783.1-201ENST00000612976 329 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
TRDMT1O14717 U6atac.1-201ENST00000616025 117 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
TRDMT1O14717 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
TRDMT1O14717 SNORD49B-201ENST00000365172 72 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
TRDMT1O14717 MIR876-201ENST00000401147 81 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
TRDMT1O14717 Y_RNA.610-201ENST00000410681 103 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
TRDMT1O14717 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
TRDMT1O14717 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
TRDMT1O14717 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.61□□□□□ -2.51
TRDMT1O14717 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
TRDMT1O14717 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
TRDMT1O14717 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
TRDMT1O14717 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
TRDMT1O14717 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
TRDMT1O14717 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
TRDMT1O14717 MIR655-201ENST00000362159 97 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
TRDMT1O14717 MIR224-201ENST00000384889 81 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
TRDMT1O14717 AC138393.2-201ENST00000414742 246 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
TRDMT1O14717 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
TRDMT1O14717 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
TRDMT1O14717 MIR4788-201ENST00000639104 80 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
TRDMT1O14717 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
TRDMT1O14717 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
TRDMT1O14717 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
TRDMT1O14717 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
TRDMT1O14717 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
TRDMT1O14717 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
TRDMT1O14717 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
TRDMT1O14717 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC-0.63□□□□□ -2.51
TRDMT1O14717 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
TRDMT1O14717 AL391099.1-201ENST00000624635 187 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
TRDMT1O14717 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
TRDMT1O14717 RNU4-40P-201ENST00000364351 143 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
TRDMT1O14717 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
TRDMT1O14717 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
TRDMT1O14717 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
TRDMT1O14717 FGF7P4-201ENST00000509595 295 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
TRDMT1O14717 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
TRDMT1O14717 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
TRDMT1O14717 AL627230.5-201ENST00000619807 58 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
TRDMT1O14717 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC-0.64□□□□□ -2.51
TRDMT1O14717 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
TRDMT1O14717 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
TRDMT1O14717 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
TRDMT1O14717 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
TRDMT1O14717 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
TRDMT1O14717 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
TRDMT1O14717 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
TRDMT1O14717 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
TRDMT1O14717 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
TRDMT1O14717 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
TRDMT1O14717 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
TRDMT1O14717 MIR4432-201ENST00000581823 84 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
TRDMT1O14717 MIR4263-201ENST00000584745 83 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
TRDMT1O14717 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
TRDMT1O14717 AL590491.3-201ENST00000610731 82 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
TRDMT1O14717 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC-0.66□□□□□ -2.52
TRDMT1O14717 AC084368.1-201ENST00000620935 65 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
TRDMT1O14717 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
TRDMT1O14717 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
TRDMT1O14717 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
TRDMT1O14717 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
TRDMT1O14717 RNU6-30P-201ENST00000384561 107 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
TRDMT1O14717 AC244250.2-201ENST00000418731 148 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
TRDMT1O14717 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
TRDMT1O14717 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.9 ms