Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP2

Vmn2r25, MCG130582, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r25W4VSP2 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Vmn2r25W4VSP2 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Vmn2r25W4VSP2 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Vmn2r25W4VSP2 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn2r25W4VSP2 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn2r25W4VSP2 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn2r25W4VSP2 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn2r25W4VSP2 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn2r25W4VSP2 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn2r25W4VSP2 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn2r25W4VSP2 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn2r25W4VSP2 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn2r25W4VSP2 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn2r25W4VSP2 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn2r25W4VSP2 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn2r25W4VSP2 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn2r25W4VSP2 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn2r25W4VSP2 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn2r25W4VSP2 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn2r25W4VSP2 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn2r25W4VSP2 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn2r25W4VSP2 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn2r25W4VSP2 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn2r25W4VSP2 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn2r25W4VSP2 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn2r25W4VSP2 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn2r25W4VSP2 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn2r25W4VSP2 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn2r25W4VSP2 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn2r25W4VSP2 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn2r25W4VSP2 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn2r25W4VSP2 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn2r25W4VSP2 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn2r25W4VSP2 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn2r25W4VSP2 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn2r25W4VSP2 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn2r25W4VSP2 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn2r25W4VSP2 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn2r25W4VSP2 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn2r25W4VSP2 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn2r25W4VSP2 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn2r25W4VSP2 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn2r25W4VSP2 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn2r25W4VSP2 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn2r25W4VSP2 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn2r25W4VSP2 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn2r25W4VSP2 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn2r25W4VSP2 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn2r25W4VSP2 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn2r25W4VSP2 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn2r25W4VSP2 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn2r25W4VSP2 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn2r25W4VSP2 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn2r25W4VSP2 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn2r25W4VSP2 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn2r25W4VSP2 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn2r25W4VSP2 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn2r25W4VSP2 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn2r25W4VSP2 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn2r25W4VSP2 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn2r25W4VSP2 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn2r25W4VSP2 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn2r25W4VSP2 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn2r25W4VSP2 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn2r25W4VSP2 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn2r25W4VSP2 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn2r25W4VSP2 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn2r25W4VSP2 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn2r25W4VSP2 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn2r25W4VSP2 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn2r25W4VSP2 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn2r25W4VSP2 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn2r25W4VSP2 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn2r25W4VSP2 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn2r25W4VSP2 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn2r25W4VSP2 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn2r25W4VSP2 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn2r25W4VSP2 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn2r25W4VSP2 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn2r25W4VSP2 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn2r25W4VSP2 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn2r25W4VSP2 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn2r25W4VSP2 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn2r25W4VSP2 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn2r25W4VSP2 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn2r25W4VSP2 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn2r25W4VSP2 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn2r25W4VSP2 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn2r25W4VSP2 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn2r25W4VSP2 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn2r25W4VSP2 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn2r25W4VSP2 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn2r25W4VSP2 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn2r25W4VSP2 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn2r25W4VSP2 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn2r25W4VSP2 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn2r25W4VSP2 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn2r25W4VSP2 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn2r25W4VSP2 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn2r25W4VSP2 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms