Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ChmQ9QXG2 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ChmQ9QXG2 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ChmQ9QXG2 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ChmQ9QXG2 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ChmQ9QXG2 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ChmQ9QXG2 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ChmQ9QXG2 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ChmQ9QXG2 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ChmQ9QXG2 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ChmQ9QXG2 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ChmQ9QXG2 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ChmQ9QXG2 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ChmQ9QXG2 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ChmQ9QXG2 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ChmQ9QXG2 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ChmQ9QXG2 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ChmQ9QXG2 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ChmQ9QXG2 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ChmQ9QXG2 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ChmQ9QXG2 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ChmQ9QXG2 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ChmQ9QXG2 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ChmQ9QXG2 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ChmQ9QXG2 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ChmQ9QXG2 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ChmQ9QXG2 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ChmQ9QXG2 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ChmQ9QXG2 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ChmQ9QXG2 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ChmQ9QXG2 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ChmQ9QXG2 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ChmQ9QXG2 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ChmQ9QXG2 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ChmQ9QXG2 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ChmQ9QXG2 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ChmQ9QXG2 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ChmQ9QXG2 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ChmQ9QXG2 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ChmQ9QXG2 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ChmQ9QXG2 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ChmQ9QXG2 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ChmQ9QXG2 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ChmQ9QXG2 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ChmQ9QXG2 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ChmQ9QXG2 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ChmQ9QXG2 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ChmQ9QXG2 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ChmQ9QXG2 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ChmQ9QXG2 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ChmQ9QXG2 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ChmQ9QXG2 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ChmQ9QXG2 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ChmQ9QXG2 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ChmQ9QXG2 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ChmQ9QXG2 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ChmQ9QXG2 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ChmQ9QXG2 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ChmQ9QXG2 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ChmQ9QXG2 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ChmQ9QXG2 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ChmQ9QXG2 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ChmQ9QXG2 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ChmQ9QXG2 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ChmQ9QXG2 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ChmQ9QXG2 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ChmQ9QXG2 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ChmQ9QXG2 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ChmQ9QXG2 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ChmQ9QXG2 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ChmQ9QXG2 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ChmQ9QXG2 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ChmQ9QXG2 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ChmQ9QXG2 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ChmQ9QXG2 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ChmQ9QXG2 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ChmQ9QXG2 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ChmQ9QXG2 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ChmQ9QXG2 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ChmQ9QXG2 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ChmQ9QXG2 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ChmQ9QXG2 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ChmQ9QXG2 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ChmQ9QXG2 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ChmQ9QXG2 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ChmQ9QXG2 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ChmQ9QXG2 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ChmQ9QXG2 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ChmQ9QXG2 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ChmQ9QXG2 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ChmQ9QXG2 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ChmQ9QXG2 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ChmQ9QXG2 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ChmQ9QXG2 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ChmQ9QXG2 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ChmQ9QXG2 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ChmQ9QXG2 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ChmQ9QXG2 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ChmQ9QXG2 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ChmQ9QXG2 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms