Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB9

Nectin3, Nectin-3, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin3Q9JLB9 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nectin3Q9JLB9 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nectin3Q9JLB9 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nectin3Q9JLB9 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nectin3Q9JLB9 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Nectin3Q9JLB9 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nectin3Q9JLB9 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Nectin3Q9JLB9 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nectin3Q9JLB9 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nectin3Q9JLB9 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nectin3Q9JLB9 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nectin3Q9JLB9 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nectin3Q9JLB9 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nectin3Q9JLB9 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nectin3Q9JLB9 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nectin3Q9JLB9 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nectin3Q9JLB9 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Nectin3Q9JLB9 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Nectin3Q9JLB9 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Nectin3Q9JLB9 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Nectin3Q9JLB9 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nectin3Q9JLB9 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nectin3Q9JLB9 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Nectin3Q9JLB9 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nectin3Q9JLB9 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nectin3Q9JLB9 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nectin3Q9JLB9 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nectin3Q9JLB9 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nectin3Q9JLB9 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nectin3Q9JLB9 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nectin3Q9JLB9 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nectin3Q9JLB9 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nectin3Q9JLB9 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nectin3Q9JLB9 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nectin3Q9JLB9 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nectin3Q9JLB9 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nectin3Q9JLB9 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Nectin3Q9JLB9 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nectin3Q9JLB9 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Nectin3Q9JLB9 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nectin3Q9JLB9 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Nectin3Q9JLB9 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nectin3Q9JLB9 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Nectin3Q9JLB9 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Nectin3Q9JLB9 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Nectin3Q9JLB9 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Nectin3Q9JLB9 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Nectin3Q9JLB9 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Nectin3Q9JLB9 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Nectin3Q9JLB9 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
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Nectin3Q9JLB9 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Nectin3Q9JLB9 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Nectin3Q9JLB9 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Nectin3Q9JLB9 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nectin3Q9JLB9 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nectin3Q9JLB9 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nectin3Q9JLB9 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nectin3Q9JLB9 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nectin3Q9JLB9 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nectin3Q9JLB9 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nectin3Q9JLB9 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nectin3Q9JLB9 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nectin3Q9JLB9 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nectin3Q9JLB9 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nectin3Q9JLB9 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nectin3Q9JLB9 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nectin3Q9JLB9 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Nectin3Q9JLB9 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nectin3Q9JLB9 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nectin3Q9JLB9 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nectin3Q9JLB9 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nectin3Q9JLB9 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nectin3Q9JLB9 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nectin3Q9JLB9 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nectin3Q9JLB9 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nectin3Q9JLB9 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nectin3Q9JLB9 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nectin3Q9JLB9 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nectin3Q9JLB9 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nectin3Q9JLB9 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nectin3Q9JLB9 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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