Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms