Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc83Q9D4V3 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc83Q9D4V3 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc83Q9D4V3 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc83Q9D4V3 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc83Q9D4V3 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc83Q9D4V3 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc83Q9D4V3 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc83Q9D4V3 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc83Q9D4V3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc83Q9D4V3 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc83Q9D4V3 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc83Q9D4V3 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc83Q9D4V3 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc83Q9D4V3 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc83Q9D4V3 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc83Q9D4V3 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc83Q9D4V3 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc83Q9D4V3 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc83Q9D4V3 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc83Q9D4V3 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc83Q9D4V3 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc83Q9D4V3 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc83Q9D4V3 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc83Q9D4V3 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc83Q9D4V3 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc83Q9D4V3 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc83Q9D4V3 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc83Q9D4V3 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc83Q9D4V3 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc83Q9D4V3 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc83Q9D4V3 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc83Q9D4V3 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc83Q9D4V3 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc83Q9D4V3 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc83Q9D4V3 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc83Q9D4V3 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc83Q9D4V3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc83Q9D4V3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc83Q9D4V3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc83Q9D4V3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc83Q9D4V3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc83Q9D4V3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc83Q9D4V3 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc83Q9D4V3 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc83Q9D4V3 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc83Q9D4V3 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc83Q9D4V3 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc83Q9D4V3 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc83Q9D4V3 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc83Q9D4V3 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc83Q9D4V3 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc83Q9D4V3 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc83Q9D4V3 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc83Q9D4V3 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc83Q9D4V3 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc83Q9D4V3 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc83Q9D4V3 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc83Q9D4V3 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc83Q9D4V3 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc83Q9D4V3 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc83Q9D4V3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc83Q9D4V3 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc83Q9D4V3 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc83Q9D4V3 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc83Q9D4V3 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc83Q9D4V3 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc83Q9D4V3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc83Q9D4V3 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc83Q9D4V3 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc83Q9D4V3 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc83Q9D4V3 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc83Q9D4V3 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc83Q9D4V3 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc83Q9D4V3 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc83Q9D4V3 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc83Q9D4V3 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc83Q9D4V3 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc83Q9D4V3 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc83Q9D4V3 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc83Q9D4V3 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc83Q9D4V3 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc83Q9D4V3 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc83Q9D4V3 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc83Q9D4V3 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc83Q9D4V3 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc83Q9D4V3 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc83Q9D4V3 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc83Q9D4V3 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc83Q9D4V3 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc83Q9D4V3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc83Q9D4V3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc83Q9D4V3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc83Q9D4V3 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc83Q9D4V3 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc83Q9D4V3 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc83Q9D4V3 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc83Q9D4V3 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc83Q9D4V3 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc83Q9D4V3 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms