Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
FYCO1Q9BQS8 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
FYCO1Q9BQS8 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
FYCO1Q9BQS8 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
FYCO1Q9BQS8 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
FYCO1Q9BQS8 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
FYCO1Q9BQS8 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
FYCO1Q9BQS8 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
FYCO1Q9BQS8 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
FYCO1Q9BQS8 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
FYCO1Q9BQS8 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
FYCO1Q9BQS8 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
FYCO1Q9BQS8 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
FYCO1Q9BQS8 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
FYCO1Q9BQS8 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
FYCO1Q9BQS8 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
FYCO1Q9BQS8 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
FYCO1Q9BQS8 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
FYCO1Q9BQS8 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
FYCO1Q9BQS8 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
FYCO1Q9BQS8 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
FYCO1Q9BQS8 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
FYCO1Q9BQS8 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
FYCO1Q9BQS8 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
FYCO1Q9BQS8 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
FYCO1Q9BQS8 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
FYCO1Q9BQS8 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
FYCO1Q9BQS8 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
FYCO1Q9BQS8 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
FYCO1Q9BQS8 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
FYCO1Q9BQS8 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
FYCO1Q9BQS8 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
FYCO1Q9BQS8 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
FYCO1Q9BQS8 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
FYCO1Q9BQS8 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
FYCO1Q9BQS8 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
FYCO1Q9BQS8 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
FYCO1Q9BQS8 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
FYCO1Q9BQS8 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
FYCO1Q9BQS8 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
FYCO1Q9BQS8 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
FYCO1Q9BQS8 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
FYCO1Q9BQS8 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
FYCO1Q9BQS8 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
FYCO1Q9BQS8 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
FYCO1Q9BQS8 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
FYCO1Q9BQS8 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
FYCO1Q9BQS8 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
FYCO1Q9BQS8 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
FYCO1Q9BQS8 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
FYCO1Q9BQS8 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
FYCO1Q9BQS8 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
FYCO1Q9BQS8 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
FYCO1Q9BQS8 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
FYCO1Q9BQS8 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
FYCO1Q9BQS8 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
FYCO1Q9BQS8 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
FYCO1Q9BQS8 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
FYCO1Q9BQS8 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
FYCO1Q9BQS8 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
FYCO1Q9BQS8 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
FYCO1Q9BQS8 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
FYCO1Q9BQS8 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
FYCO1Q9BQS8 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
FYCO1Q9BQS8 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
FYCO1Q9BQS8 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
FYCO1Q9BQS8 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
FYCO1Q9BQS8 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
FYCO1Q9BQS8 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
FYCO1Q9BQS8 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
FYCO1Q9BQS8 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
FYCO1Q9BQS8 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
FYCO1Q9BQS8 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
FYCO1Q9BQS8 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
FYCO1Q9BQS8 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
FYCO1Q9BQS8 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
FYCO1Q9BQS8 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
FYCO1Q9BQS8 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
FYCO1Q9BQS8 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
FYCO1Q9BQS8 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
FYCO1Q9BQS8 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
FYCO1Q9BQS8 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
FYCO1Q9BQS8 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
FYCO1Q9BQS8 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
FYCO1Q9BQS8 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
FYCO1Q9BQS8 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
FYCO1Q9BQS8 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
FYCO1Q9BQS8 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
FYCO1Q9BQS8 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
FYCO1Q9BQS8 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
FYCO1Q9BQS8 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
FYCO1Q9BQS8 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
FYCO1Q9BQS8 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
FYCO1Q9BQS8 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
FYCO1Q9BQS8 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
FYCO1Q9BQS8 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
FYCO1Q9BQS8 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
FYCO1Q9BQS8 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
FYCO1Q9BQS8 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
FYCO1Q9BQS8 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms