Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEJ8

Gm9955, Predicted gene 9955 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9955Q8CEJ8 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Gm9955Q8CEJ8 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Gm9955Q8CEJ8 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Gm9955Q8CEJ8 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Gm9955Q8CEJ8 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Gm9955Q8CEJ8 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Gm9955Q8CEJ8 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Gm9955Q8CEJ8 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Gm9955Q8CEJ8 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Gm9955Q8CEJ8 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Gm9955Q8CEJ8 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Gm9955Q8CEJ8 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Gm9955Q8CEJ8 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Gm9955Q8CEJ8 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Gm9955Q8CEJ8 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Gm9955Q8CEJ8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Gm9955Q8CEJ8 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Gm9955Q8CEJ8 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Gm9955Q8CEJ8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Gm9955Q8CEJ8 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Gm9955Q8CEJ8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Gm9955Q8CEJ8 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Gm9955Q8CEJ8 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Gm9955Q8CEJ8 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Gm9955Q8CEJ8 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Gm9955Q8CEJ8 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Gm9955Q8CEJ8 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Gm9955Q8CEJ8 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Gm9955Q8CEJ8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Gm9955Q8CEJ8 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Gm9955Q8CEJ8 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Gm9955Q8CEJ8 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Gm9955Q8CEJ8 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Gm9955Q8CEJ8 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Gm9955Q8CEJ8 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Gm9955Q8CEJ8 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Gm9955Q8CEJ8 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Gm9955Q8CEJ8 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Gm9955Q8CEJ8 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Gm9955Q8CEJ8 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Gm9955Q8CEJ8 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Gm9955Q8CEJ8 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Gm9955Q8CEJ8 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Gm9955Q8CEJ8 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
Gm9955Q8CEJ8 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Gm9955Q8CEJ8 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
Gm9955Q8CEJ8 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Gm9955Q8CEJ8 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Gm9955Q8CEJ8 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
Gm9955Q8CEJ8 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Gm9955Q8CEJ8 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Gm9955Q8CEJ8 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
Gm9955Q8CEJ8 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Gm9955Q8CEJ8 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Gm9955Q8CEJ8 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Gm9955Q8CEJ8 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Gm9955Q8CEJ8 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Gm9955Q8CEJ8 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Gm9955Q8CEJ8 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Gm9955Q8CEJ8 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Gm9955Q8CEJ8 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Gm9955Q8CEJ8 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Gm9955Q8CEJ8 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Gm9955Q8CEJ8 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Gm9955Q8CEJ8 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Gm9955Q8CEJ8 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Gm9955Q8CEJ8 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Gm9955Q8CEJ8 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Gm9955Q8CEJ8 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Gm9955Q8CEJ8 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Gm9955Q8CEJ8 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Gm9955Q8CEJ8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Gm9955Q8CEJ8 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Gm9955Q8CEJ8 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Gm9955Q8CEJ8 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Gm9955Q8CEJ8 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Gm9955Q8CEJ8 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Gm9955Q8CEJ8 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Gm9955Q8CEJ8 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Gm9955Q8CEJ8 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Gm9955Q8CEJ8 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Gm9955Q8CEJ8 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Gm9955Q8CEJ8 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Gm9955Q8CEJ8 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Gm9955Q8CEJ8 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Gm9955Q8CEJ8 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Gm9955Q8CEJ8 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Gm9955Q8CEJ8 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Gm9955Q8CEJ8 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Gm9955Q8CEJ8 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Gm9955Q8CEJ8 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Gm9955Q8CEJ8 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Gm9955Q8CEJ8 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Gm9955Q8CEJ8 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Gm9955Q8CEJ8 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Gm9955Q8CEJ8 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Gm9955Q8CEJ8 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Gm9955Q8CEJ8 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Gm9955Q8CEJ8 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Gm9955Q8CEJ8 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms