Protein–RNA interactions for Protein: Q80YS5

Lrrc27, Leucine-rich repeat-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc27Q80YS5 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrc27Q80YS5 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrc27Q80YS5 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrc27Q80YS5 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrc27Q80YS5 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrc27Q80YS5 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrc27Q80YS5 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrc27Q80YS5 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrc27Q80YS5 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrc27Q80YS5 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrc27Q80YS5 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
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Lrrc27Q80YS5 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc27Q80YS5 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc27Q80YS5 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc27Q80YS5 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc27Q80YS5 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc27Q80YS5 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc27Q80YS5 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc27Q80YS5 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc27Q80YS5 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc27Q80YS5 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc27Q80YS5 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc27Q80YS5 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc27Q80YS5 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc27Q80YS5 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc27Q80YS5 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc27Q80YS5 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc27Q80YS5 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc27Q80YS5 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc27Q80YS5 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc27Q80YS5 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc27Q80YS5 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc27Q80YS5 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc27Q80YS5 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc27Q80YS5 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc27Q80YS5 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc27Q80YS5 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc27Q80YS5 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc27Q80YS5 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc27Q80YS5 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc27Q80YS5 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc27Q80YS5 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc27Q80YS5 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Lrrc27Q80YS5 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Lrrc27Q80YS5 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Lrrc27Q80YS5 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc27Q80YS5 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc27Q80YS5 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc27Q80YS5 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc27Q80YS5 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Lrrc27Q80YS5 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc27Q80YS5 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Lrrc27Q80YS5 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Lrrc27Q80YS5 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc27Q80YS5 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc27Q80YS5 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc27Q80YS5 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc27Q80YS5 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc27Q80YS5 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Lrrc27Q80YS5 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc27Q80YS5 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc27Q80YS5 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc27Q80YS5 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc27Q80YS5 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc27Q80YS5 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc27Q80YS5 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc27Q80YS5 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc27Q80YS5 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc27Q80YS5 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc27Q80YS5 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc27Q80YS5 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc27Q80YS5 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc27Q80YS5 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc27Q80YS5 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc27Q80YS5 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc27Q80YS5 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc27Q80YS5 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc27Q80YS5 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc27Q80YS5 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms