Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSC3

Nek5, Serine/threonine-protein kinase Nek5, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek5Q7TSC3 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nek5Q7TSC3 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nek5Q7TSC3 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nek5Q7TSC3 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nek5Q7TSC3 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nek5Q7TSC3 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nek5Q7TSC3 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nek5Q7TSC3 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nek5Q7TSC3 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nek5Q7TSC3 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nek5Q7TSC3 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nek5Q7TSC3 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nek5Q7TSC3 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nek5Q7TSC3 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nek5Q7TSC3 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nek5Q7TSC3 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Nek5Q7TSC3 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nek5Q7TSC3 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nek5Q7TSC3 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nek5Q7TSC3 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nek5Q7TSC3 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nek5Q7TSC3 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nek5Q7TSC3 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nek5Q7TSC3 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nek5Q7TSC3 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nek5Q7TSC3 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nek5Q7TSC3 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nek5Q7TSC3 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nek5Q7TSC3 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nek5Q7TSC3 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nek5Q7TSC3 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nek5Q7TSC3 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nek5Q7TSC3 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nek5Q7TSC3 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nek5Q7TSC3 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nek5Q7TSC3 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nek5Q7TSC3 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Nek5Q7TSC3 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Nek5Q7TSC3 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nek5Q7TSC3 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nek5Q7TSC3 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nek5Q7TSC3 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nek5Q7TSC3 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nek5Q7TSC3 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nek5Q7TSC3 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nek5Q7TSC3 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nek5Q7TSC3 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nek5Q7TSC3 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nek5Q7TSC3 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nek5Q7TSC3 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nek5Q7TSC3 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nek5Q7TSC3 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek5Q7TSC3 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek5Q7TSC3 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek5Q7TSC3 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek5Q7TSC3 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek5Q7TSC3 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek5Q7TSC3 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek5Q7TSC3 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek5Q7TSC3 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek5Q7TSC3 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek5Q7TSC3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek5Q7TSC3 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek5Q7TSC3 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek5Q7TSC3 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek5Q7TSC3 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek5Q7TSC3 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek5Q7TSC3 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek5Q7TSC3 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek5Q7TSC3 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek5Q7TSC3 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek5Q7TSC3 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek5Q7TSC3 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek5Q7TSC3 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek5Q7TSC3 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nek5Q7TSC3 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nek5Q7TSC3 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nek5Q7TSC3 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nek5Q7TSC3 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nek5Q7TSC3 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nek5Q7TSC3 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nek5Q7TSC3 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Nek5Q7TSC3 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nek5Q7TSC3 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nek5Q7TSC3 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nek5Q7TSC3 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nek5Q7TSC3 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nek5Q7TSC3 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nek5Q7TSC3 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nek5Q7TSC3 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nek5Q7TSC3 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nek5Q7TSC3 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nek5Q7TSC3 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nek5Q7TSC3 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nek5Q7TSC3 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nek5Q7TSC3 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nek5Q7TSC3 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nek5Q7TSC3 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nek5Q7TSC3 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nek5Q7TSC3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms