Protein–RNA interactions for Protein: Q6W8Q3

Pcp4l1, Purkinje cell protein 4-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcp4l1Q6W8Q3 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pcp4l1Q6W8Q3 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pcp4l1Q6W8Q3 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pcp4l1Q6W8Q3 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pcp4l1Q6W8Q3 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pcp4l1Q6W8Q3 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pcp4l1Q6W8Q3 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pcp4l1Q6W8Q3 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pcp4l1Q6W8Q3 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pcp4l1Q6W8Q3 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pcp4l1Q6W8Q3 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pcp4l1Q6W8Q3 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pcp4l1Q6W8Q3 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pcp4l1Q6W8Q3 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pcp4l1Q6W8Q3 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pcp4l1Q6W8Q3 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pcp4l1Q6W8Q3 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pcp4l1Q6W8Q3 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pcp4l1Q6W8Q3 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pcp4l1Q6W8Q3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Pcp4l1Q6W8Q3 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pcp4l1Q6W8Q3 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pcp4l1Q6W8Q3 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pcp4l1Q6W8Q3 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pcp4l1Q6W8Q3 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pcp4l1Q6W8Q3 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pcp4l1Q6W8Q3 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pcp4l1Q6W8Q3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pcp4l1Q6W8Q3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pcp4l1Q6W8Q3 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pcp4l1Q6W8Q3 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pcp4l1Q6W8Q3 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pcp4l1Q6W8Q3 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pcp4l1Q6W8Q3 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pcp4l1Q6W8Q3 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pcp4l1Q6W8Q3 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pcp4l1Q6W8Q3 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pcp4l1Q6W8Q3 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pcp4l1Q6W8Q3 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pcp4l1Q6W8Q3 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pcp4l1Q6W8Q3 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pcp4l1Q6W8Q3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pcp4l1Q6W8Q3 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pcp4l1Q6W8Q3 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pcp4l1Q6W8Q3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pcp4l1Q6W8Q3 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pcp4l1Q6W8Q3 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pcp4l1Q6W8Q3 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pcp4l1Q6W8Q3 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pcp4l1Q6W8Q3 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pcp4l1Q6W8Q3 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pcp4l1Q6W8Q3 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pcp4l1Q6W8Q3 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pcp4l1Q6W8Q3 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pcp4l1Q6W8Q3 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pcp4l1Q6W8Q3 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pcp4l1Q6W8Q3 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pcp4l1Q6W8Q3 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pcp4l1Q6W8Q3 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pcp4l1Q6W8Q3 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Pcp4l1Q6W8Q3 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pcp4l1Q6W8Q3 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pcp4l1Q6W8Q3 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pcp4l1Q6W8Q3 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pcp4l1Q6W8Q3 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pcp4l1Q6W8Q3 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pcp4l1Q6W8Q3 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pcp4l1Q6W8Q3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pcp4l1Q6W8Q3 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pcp4l1Q6W8Q3 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pcp4l1Q6W8Q3 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pcp4l1Q6W8Q3 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pcp4l1Q6W8Q3 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pcp4l1Q6W8Q3 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pcp4l1Q6W8Q3 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pcp4l1Q6W8Q3 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pcp4l1Q6W8Q3 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pcp4l1Q6W8Q3 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pcp4l1Q6W8Q3 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pcp4l1Q6W8Q3 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pcp4l1Q6W8Q3 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Pcp4l1Q6W8Q3 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pcp4l1Q6W8Q3 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pcp4l1Q6W8Q3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pcp4l1Q6W8Q3 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pcp4l1Q6W8Q3 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pcp4l1Q6W8Q3 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pcp4l1Q6W8Q3 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pcp4l1Q6W8Q3 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pcp4l1Q6W8Q3 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pcp4l1Q6W8Q3 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pcp4l1Q6W8Q3 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pcp4l1Q6W8Q3 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pcp4l1Q6W8Q3 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms