Protein–RNA interactions for Protein: Q6VUP9

Tfap2e, Transcription factor AP-2-epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2eQ6VUP9 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tfap2eQ6VUP9 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Tfap2eQ6VUP9 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tfap2eQ6VUP9 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tfap2eQ6VUP9 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tfap2eQ6VUP9 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tfap2eQ6VUP9 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tfap2eQ6VUP9 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Tfap2eQ6VUP9 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tfap2eQ6VUP9 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tfap2eQ6VUP9 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tfap2eQ6VUP9 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Tfap2eQ6VUP9 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tfap2eQ6VUP9 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tfap2eQ6VUP9 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tfap2eQ6VUP9 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tfap2eQ6VUP9 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Tfap2eQ6VUP9 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tfap2eQ6VUP9 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tfap2eQ6VUP9 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tfap2eQ6VUP9 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tfap2eQ6VUP9 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Tfap2eQ6VUP9 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tfap2eQ6VUP9 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tfap2eQ6VUP9 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tfap2eQ6VUP9 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Tfap2eQ6VUP9 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tfap2eQ6VUP9 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tfap2eQ6VUP9 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tfap2eQ6VUP9 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tfap2eQ6VUP9 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tfap2eQ6VUP9 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tfap2eQ6VUP9 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tfap2eQ6VUP9 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tfap2eQ6VUP9 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tfap2eQ6VUP9 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tfap2eQ6VUP9 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tfap2eQ6VUP9 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tfap2eQ6VUP9 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tfap2eQ6VUP9 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tfap2eQ6VUP9 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tfap2eQ6VUP9 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tfap2eQ6VUP9 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tfap2eQ6VUP9 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tfap2eQ6VUP9 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tfap2eQ6VUP9 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tfap2eQ6VUP9 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tfap2eQ6VUP9 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tfap2eQ6VUP9 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tfap2eQ6VUP9 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tfap2eQ6VUP9 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tfap2eQ6VUP9 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tfap2eQ6VUP9 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tfap2eQ6VUP9 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tfap2eQ6VUP9 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tfap2eQ6VUP9 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tfap2eQ6VUP9 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tfap2eQ6VUP9 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tfap2eQ6VUP9 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tfap2eQ6VUP9 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tfap2eQ6VUP9 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tfap2eQ6VUP9 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tfap2eQ6VUP9 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tfap2eQ6VUP9 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tfap2eQ6VUP9 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tfap2eQ6VUP9 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Tfap2eQ6VUP9 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tfap2eQ6VUP9 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tfap2eQ6VUP9 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tfap2eQ6VUP9 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tfap2eQ6VUP9 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tfap2eQ6VUP9 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Tfap2eQ6VUP9 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tfap2eQ6VUP9 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tfap2eQ6VUP9 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tfap2eQ6VUP9 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tfap2eQ6VUP9 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tfap2eQ6VUP9 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tfap2eQ6VUP9 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tfap2eQ6VUP9 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tfap2eQ6VUP9 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Tfap2eQ6VUP9 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tfap2eQ6VUP9 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tfap2eQ6VUP9 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tfap2eQ6VUP9 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tfap2eQ6VUP9 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tfap2eQ6VUP9 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tfap2eQ6VUP9 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tfap2eQ6VUP9 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tfap2eQ6VUP9 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tfap2eQ6VUP9 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tfap2eQ6VUP9 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tfap2eQ6VUP9 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tfap2eQ6VUP9 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tfap2eQ6VUP9 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tfap2eQ6VUP9 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tfap2eQ6VUP9 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tfap2eQ6VUP9 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tfap2eQ6VUP9 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tfap2eQ6VUP9 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms