Protein–RNA interactions for Protein: Q62465

Vat1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vat1Q62465 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vat1Q62465 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Vat1Q62465 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vat1Q62465 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vat1Q62465 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Vat1Q62465 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vat1Q62465 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vat1Q62465 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vat1Q62465 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vat1Q62465 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vat1Q62465 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Vat1Q62465 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Vat1Q62465 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vat1Q62465 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vat1Q62465 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vat1Q62465 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vat1Q62465 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vat1Q62465 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vat1Q62465 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Vat1Q62465 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vat1Q62465 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vat1Q62465 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vat1Q62465 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vat1Q62465 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vat1Q62465 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vat1Q62465 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vat1Q62465 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vat1Q62465 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vat1Q62465 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vat1Q62465 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vat1Q62465 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vat1Q62465 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vat1Q62465 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vat1Q62465 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vat1Q62465 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vat1Q62465 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vat1Q62465 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vat1Q62465 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vat1Q62465 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Vat1Q62465 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vat1Q62465 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vat1Q62465 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vat1Q62465 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vat1Q62465 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vat1Q62465 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vat1Q62465 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vat1Q62465 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vat1Q62465 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vat1Q62465 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vat1Q62465 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vat1Q62465 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vat1Q62465 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vat1Q62465 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vat1Q62465 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vat1Q62465 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vat1Q62465 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vat1Q62465 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vat1Q62465 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vat1Q62465 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vat1Q62465 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vat1Q62465 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vat1Q62465 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vat1Q62465 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vat1Q62465 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vat1Q62465 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vat1Q62465 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vat1Q62465 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vat1Q62465 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vat1Q62465 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vat1Q62465 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vat1Q62465 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vat1Q62465 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vat1Q62465 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vat1Q62465 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vat1Q62465 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vat1Q62465 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vat1Q62465 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vat1Q62465 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vat1Q62465 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vat1Q62465 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vat1Q62465 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vat1Q62465 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vat1Q62465 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vat1Q62465 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vat1Q62465 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vat1Q62465 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vat1Q62465 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vat1Q62465 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vat1Q62465 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vat1Q62465 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vat1Q62465 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vat1Q62465 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vat1Q62465 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vat1Q62465 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vat1Q62465 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vat1Q62465 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vat1Q62465 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vat1Q62465 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vat1Q62465 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vat1Q62465 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms