Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSD8

Putative uncharacterized protein LOC401522, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5VSD8 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Q5VSD8 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q5VSD8 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q5VSD8 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q5VSD8 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q5VSD8 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q5VSD8 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Q5VSD8 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q5VSD8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q5VSD8 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
Q5VSD8 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Q5VSD8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Q5VSD8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Q5VSD8 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Q5VSD8 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Q5VSD8 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Q5VSD8 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Q5VSD8 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Q5VSD8 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Q5VSD8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Q5VSD8 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Q5VSD8 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Q5VSD8 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Q5VSD8 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Q5VSD8 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Q5VSD8 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Q5VSD8 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Q5VSD8 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Q5VSD8 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Q5VSD8 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Q5VSD8 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Q5VSD8 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Q5VSD8 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Q5VSD8 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Q5VSD8 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Q5VSD8 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Q5VSD8 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Q5VSD8 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Q5VSD8 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Q5VSD8 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Q5VSD8 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Q5VSD8 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Q5VSD8 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Q5VSD8 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Q5VSD8 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Q5VSD8 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Q5VSD8 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Q5VSD8 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Q5VSD8 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Q5VSD8 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Q5VSD8 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Q5VSD8 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Q5VSD8 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Q5VSD8 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Q5VSD8 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Q5VSD8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Q5VSD8 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Q5VSD8 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Q5VSD8 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Q5VSD8 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q5VSD8 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q5VSD8 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q5VSD8 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q5VSD8 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q5VSD8 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q5VSD8 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q5VSD8 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q5VSD8 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q5VSD8 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q5VSD8 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q5VSD8 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q5VSD8 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q5VSD8 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q5VSD8 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q5VSD8 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q5VSD8 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q5VSD8 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Q5VSD8 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Q5VSD8 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q5VSD8 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q5VSD8 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q5VSD8 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Q5VSD8 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q5VSD8 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q5VSD8 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Q5VSD8 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q5VSD8 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q5VSD8 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Q5VSD8 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Q5VSD8 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q5VSD8 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q5VSD8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q5VSD8 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q5VSD8 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q5VSD8 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q5VSD8 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q5VSD8 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q5VSD8 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q5VSD8 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q5VSD8 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms