Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXY1

Specc1, Cytospin-B, mousemouse

Predictions only

Length 1,067 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Specc1Q5SXY1 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Specc1Q5SXY1 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Specc1Q5SXY1 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Specc1Q5SXY1 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Specc1Q5SXY1 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Specc1Q5SXY1 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Specc1Q5SXY1 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Specc1Q5SXY1 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Specc1Q5SXY1 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Specc1Q5SXY1 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Specc1Q5SXY1 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Specc1Q5SXY1 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Specc1Q5SXY1 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Specc1Q5SXY1 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Specc1Q5SXY1 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Specc1Q5SXY1 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Specc1Q5SXY1 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Specc1Q5SXY1 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Specc1Q5SXY1 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Specc1Q5SXY1 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Specc1Q5SXY1 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Specc1Q5SXY1 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Specc1Q5SXY1 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Specc1Q5SXY1 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Specc1Q5SXY1 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Specc1Q5SXY1 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Specc1Q5SXY1 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Specc1Q5SXY1 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Specc1Q5SXY1 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Specc1Q5SXY1 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Specc1Q5SXY1 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Specc1Q5SXY1 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Specc1Q5SXY1 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Specc1Q5SXY1 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Specc1Q5SXY1 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Specc1Q5SXY1 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Specc1Q5SXY1 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Specc1Q5SXY1 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Specc1Q5SXY1 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Specc1Q5SXY1 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Specc1Q5SXY1 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Specc1Q5SXY1 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Specc1Q5SXY1 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Specc1Q5SXY1 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Specc1Q5SXY1 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Specc1Q5SXY1 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Specc1Q5SXY1 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Specc1Q5SXY1 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Specc1Q5SXY1 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Specc1Q5SXY1 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Specc1Q5SXY1 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Specc1Q5SXY1 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Specc1Q5SXY1 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Specc1Q5SXY1 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Specc1Q5SXY1 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Specc1Q5SXY1 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Specc1Q5SXY1 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Specc1Q5SXY1 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Specc1Q5SXY1 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Specc1Q5SXY1 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Specc1Q5SXY1 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Specc1Q5SXY1 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Specc1Q5SXY1 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Specc1Q5SXY1 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Specc1Q5SXY1 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Specc1Q5SXY1 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Specc1Q5SXY1 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Specc1Q5SXY1 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Specc1Q5SXY1 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Specc1Q5SXY1 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Specc1Q5SXY1 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Specc1Q5SXY1 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Specc1Q5SXY1 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Specc1Q5SXY1 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Specc1Q5SXY1 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Specc1Q5SXY1 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Specc1Q5SXY1 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Specc1Q5SXY1 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Specc1Q5SXY1 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Specc1Q5SXY1 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Specc1Q5SXY1 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Specc1Q5SXY1 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Specc1Q5SXY1 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Specc1Q5SXY1 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Specc1Q5SXY1 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Specc1Q5SXY1 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Specc1Q5SXY1 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Specc1Q5SXY1 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Specc1Q5SXY1 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Specc1Q5SXY1 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Specc1Q5SXY1 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Specc1Q5SXY1 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Specc1Q5SXY1 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Specc1Q5SXY1 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Specc1Q5SXY1 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Specc1Q5SXY1 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Specc1Q5SXY1 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Specc1Q5SXY1 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Specc1Q5SXY1 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Specc1Q5SXY1 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms