Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZP4

Svip, Small VCP/p97-interacting protein, mousemouse

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Length 77 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvipQ3UZP4 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Pla2g4a-201ENSMUST00000070200 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 C330027C09Rik-202ENSMUST00000117994 3977 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 4632411P08Rik-201ENSMUST00000181005 3237 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Adamdec1-201ENSMUST00000022641 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Prr30-201ENSMUST00000057718 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 CAAA01216754.1-201ENSMUST00000215882 1836 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Chd1-201ENSMUST00000024620 3196 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 A930006I01Rik-201ENSMUST00000139065 2229 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Gm42669-202ENSMUST00000160160 3080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SvipQ3UZP4 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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