Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUV9

H2-Eb2, Histocompatibility 2, class II antigen E beta2, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb2Q3UUV9 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-Eb2Q3UUV9 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-Eb2Q3UUV9 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-Eb2Q3UUV9 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-Eb2Q3UUV9 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-Eb2Q3UUV9 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-Eb2Q3UUV9 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-Eb2Q3UUV9 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
H2-Eb2Q3UUV9 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
H2-Eb2Q3UUV9 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
H2-Eb2Q3UUV9 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.08■□□□□ 0
H2-Eb2Q3UUV9 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-Eb2Q3UUV9 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-Eb2Q3UUV9 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-Eb2Q3UUV9 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.08■□□□□ 0
H2-Eb2Q3UUV9 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-Eb2Q3UUV9 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
H2-Eb2Q3UUV9 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-Eb2Q3UUV9 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-Eb2Q3UUV9 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-Eb2Q3UUV9 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
H2-Eb2Q3UUV9 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-Eb2Q3UUV9 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-Eb2Q3UUV9 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
H2-Eb2Q3UUV9 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-Eb2Q3UUV9 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.07■□□□□ 0
H2-Eb2Q3UUV9 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
H2-Eb2Q3UUV9 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-Eb2Q3UUV9 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-Eb2Q3UUV9 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-Eb2Q3UUV9 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.07■□□□□ 0
H2-Eb2Q3UUV9 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
H2-Eb2Q3UUV9 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
H2-Eb2Q3UUV9 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
H2-Eb2Q3UUV9 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
H2-Eb2Q3UUV9 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
H2-Eb2Q3UUV9 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms