Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ulk3Q3U3Q1 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms