Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
MDM2Q00987 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms