Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Irx2P81066 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Irx2P81066 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Irx2P81066 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Irx2P81066 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Irx2P81066 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Irx2P81066 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Irx2P81066 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Irx2P81066 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Irx2P81066 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Irx2P81066 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irx2P81066 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irx2P81066 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irx2P81066 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irx2P81066 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irx2P81066 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irx2P81066 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irx2P81066 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irx2P81066 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irx2P81066 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irx2P81066 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irx2P81066 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irx2P81066 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irx2P81066 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irx2P81066 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irx2P81066 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irx2P81066 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irx2P81066 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irx2P81066 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irx2P81066 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irx2P81066 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irx2P81066 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irx2P81066 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Irx2P81066 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irx2P81066 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irx2P81066 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irx2P81066 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irx2P81066 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irx2P81066 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irx2P81066 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irx2P81066 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irx2P81066 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irx2P81066 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irx2P81066 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Irx2P81066 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irx2P81066 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irx2P81066 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irx2P81066 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irx2P81066 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irx2P81066 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irx2P81066 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irx2P81066 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irx2P81066 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irx2P81066 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irx2P81066 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irx2P81066 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irx2P81066 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irx2P81066 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irx2P81066 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irx2P81066 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irx2P81066 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irx2P81066 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irx2P81066 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irx2P81066 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irx2P81066 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irx2P81066 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Irx2P81066 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irx2P81066 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irx2P81066 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irx2P81066 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irx2P81066 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irx2P81066 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irx2P81066 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irx2P81066 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irx2P81066 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irx2P81066 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Irx2P81066 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Irx2P81066 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Irx2P81066 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Irx2P81066 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Irx2P81066 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Irx2P81066 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Irx2P81066 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Irx2P81066 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Irx2P81066 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Irx2P81066 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Irx2P81066 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Irx2P81066 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Irx2P81066 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Irx2P81066 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Irx2P81066 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Irx2P81066 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Irx2P81066 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Irx2P81066 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Irx2P81066 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Irx2P81066 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Irx2P81066 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Irx2P81066 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Irx2P81066 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Irx2P81066 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms