Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HERVK_113P62684 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HERVK_113P62684 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HERVK_113P62684 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HERVK_113P62684 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HERVK_113P62684 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
HERVK_113P62684 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HERVK_113P62684 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HERVK_113P62684 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HERVK_113P62684 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HERVK_113P62684 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HERVK_113P62684 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HERVK_113P62684 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HERVK_113P62684 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HERVK_113P62684 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HERVK_113P62684 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HERVK_113P62684 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
HERVK_113P62684 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HERVK_113P62684 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HERVK_113P62684 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HERVK_113P62684 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HERVK_113P62684 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HERVK_113P62684 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HERVK_113P62684 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HERVK_113P62684 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HERVK_113P62684 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HERVK_113P62684 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HERVK_113P62684 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HERVK_113P62684 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HERVK_113P62684 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HERVK_113P62684 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HERVK_113P62684 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HERVK_113P62684 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HERVK_113P62684 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HERVK_113P62684 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HERVK_113P62684 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HERVK_113P62684 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HERVK_113P62684 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HERVK_113P62684 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
HERVK_113P62684 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HERVK_113P62684 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
HERVK_113P62684 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HERVK_113P62684 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HERVK_113P62684 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HERVK_113P62684 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HERVK_113P62684 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
HERVK_113P62684 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HERVK_113P62684 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HERVK_113P62684 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HERVK_113P62684 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HERVK_113P62684 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HERVK_113P62684 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HERVK_113P62684 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HERVK_113P62684 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HERVK_113P62684 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HERVK_113P62684 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
HERVK_113P62684 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HERVK_113P62684 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HERVK_113P62684 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HERVK_113P62684 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HERVK_113P62684 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HERVK_113P62684 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
HERVK_113P62684 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HERVK_113P62684 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HERVK_113P62684 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HERVK_113P62684 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HERVK_113P62684 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
HERVK_113P62684 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
HERVK_113P62684 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HERVK_113P62684 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HERVK_113P62684 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HERVK_113P62684 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HERVK_113P62684 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HERVK_113P62684 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HERVK_113P62684 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HERVK_113P62684 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HERVK_113P62684 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
HERVK_113P62684 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HERVK_113P62684 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
HERVK_113P62684 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HERVK_113P62684 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HERVK_113P62684 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HERVK_113P62684 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HERVK_113P62684 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HERVK_113P62684 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HERVK_113P62684 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HERVK_113P62684 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HERVK_113P62684 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HERVK_113P62684 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HERVK_113P62684 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HERVK_113P62684 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HERVK_113P62684 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HERVK_113P62684 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HERVK_113P62684 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HERVK_113P62684 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HERVK_113P62684 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HERVK_113P62684 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
HERVK_113P62684 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
HERVK_113P62684 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
HERVK_113P62684 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms